深度思考
反者，动之道
搞科研的都知道publish or perish，发文章是生存的基本要求。现在这年头，各种各样的期刊实在太多了。特别是生物医学方向，各种新期刊如雨后春笋。那么有了好的成果，投稿应该去哪里呢？老九们在一起，最喜欢争论的就是哪个期刊容易进去，哪个期刊被大家高度认可。本文抛砖引玉，胡说八道，以博一笑。
最好的期刊，当然是CNS：Cell，Nature，Science。这些期刊，影响因子高，又有很长的历史。他们是王者，应该没有争议。除了这几个“教皇”级的以外，他们的子刊也是很牛的，如Nature Biotech，Nature Materials，Cancer Cell也影响因子非常高，而且不容易进去，并且得到广泛认可的。发了这些期刊，个人感觉认可度和CNS正刊差的不多。有些子刊，如Nature Neuroscience，Science Transl Med，Nature Microbiology影响因子不是那么高，但是在该专业是唯一的子刊，影响因子也在15以上。这些子刊，在西方国家，可能认可度跟高影响因子的子刊是可以比肩的。
上述期刊都是很牛的，但是一般小民发不了。为什么呢？这些期刊的编委，都是所谓的“专业编委”。他（她）们是全职为期刊工作的，多数是领域里面的大鲨鱼（如院士，什么奖得主）的学生或者博后。他（她）们本来可能是想做学术的，但是由于方方面面的原因没有做教授；从这个意义上来说，他们的学术水平没准儿还不如一个一般学校的教授。他们对科学研究发展的方向有灵敏的嗅觉，每年有自己的计划推进这些方向的发展。这里就有个问题了：他们跟谁讨论决定下一个方向？他们决定了下一个方向后会先告诉谁？毫无疑问是他们的以前的导师和同事。这样，一般的小民，如果不在圈子里面，就不容易进去了。除了方向以外，审稿也是可能有偏见的。选什么样的人审稿，直接决定这篇文章的命运。极端的情况下，编辑如果想收这篇文章，可能找3个投稿人的朋友或者肯定会给出友好意见的人去审。这些期刊，极其重视发最新的东西，一定要在T台上走在最前面。我就知道有一次Nature 和Science的编辑，求着一个作者把文章发他们那儿去，为的就是要做leading-trend。因为他们太强调“新”，常常有不靠谱的东西发表，比如韩春雨同学的Nature Biotech，还有很多大牛的文章。有时候为了新，为了酷，一定要跟流行，老太太穿三点式上T台走秀也常常发生。（个人偏见：Cell最喜欢干这种事。）
除了以上CNS等“皇家期刊”，还有很多行业协会的会刊，影响因子在10左右的。我个人认为，这就是“有高影响力的”的期刊的门槛了。无论在中国还是西方的系统，大家看其他专业自己不懂的东西，往往看一下这个期刊的影响因子，如果大于10，那肯定不会是垃圾，放心看就是了。这些期刊的编委，一般都是教授。当教授的，当然没有时间像经营自己的公司一样去经营这个期刊，所以他们不怎么重视“我这个期刊今年的品牌是什么”。相反的，他们对今年发什么文章心里没谱：作者投过来什么文章多，他们就收什么（当然要经过严格的同行评议）。因此如果一般小民不知道今年的leading trend 是啥，或者不屑于追新（星？），在一个化石级别的方向上深挖出一块还算有点用石头来，这些仅次于CNS及其子刊的行业翘楚期刊还是发得了的。这些期刊，编辑往往包括大鲨鱼和一般资深教授。这些期刊可能对平民百姓稍微容易一些。
除了上述行业顶刊以外，还有一些影响因子5左右的所谓很扎实的（solid）期刊，如JBC，Bioinformatics，Journal of Neuroscience，Journal of immunology，Genetics等等。这些期刊往往是某个行业受大家关注很多的期刊，有的还有百年历史。能在这些上面发文章，虽然不能保证肯定有饭吃，基本上也算在领域里面立足了。这些期刊，应该文章质量过硬就上的去，不需要是大佬或者他们的圈子里面的人。
影响因子小于5的，就不好说了。有的期刊，影响因子非常低，但是也是很牛的，不容易进去的。比方说Theoretical population biology，是一个有50年历史的老刊，但是老是喜欢发一些极为艰深的理论，搞得大家看不懂没法引用，所以影响因子还不到2。这样的期刊本来在领域里面还有一席之地的，但是后来有人搞出来一个叫Open Access的东东，把整个学术出版圈子带到沟里去了。于是这些影响因子低于5的传统牛刊，大概都不好生存，沦为末流（或干脆关门大吉）是迟早的事。
好了，我们来讲讲Open Access这个怪兽。以前下载文章都是要交钱的，还很贵呢。咱中国以前穷的时候，有些正规的科研院所都没钱以学校的名义买版权，而是找一个人的名字去买（然后大家都用这个人的账号），就便宜多了。各种盗版，如俄罗斯的Sci-Hub，就一个人下了之后“造福全人类”，直接给大家免费下载。后来发生了哈佛大学的Aaron Swartz恶意下载事件，导致法律纠纷以至于当事人在宣判前自杀。于是大家觉得科学研究的成果应该是公开的，不应该搞得穷人（或穷国家）看不起论文。一堆有理想的大佬搞出来一个期刊系列，叫“Public Library of Science”（PLoS），免费下载。运营期刊是要钱的，钱从哪儿来呢？大佬们说，不能我们出啊，那就让作者出吧。这个模式下，写文章的人出钱，支持期刊的运营。如果写文章的人来自非洲（或者确实没有经费），那么根据规定减免。这样全世界的人都可以免费看文章了。Open Access有个好处就是引用会高一些，因为读者不交钱下载方便，自然引用也就方便了。我知道的PLoS系列当时有名的一篇文章就是人类基因组测序的Venter Genome在PLoS Biology上发表。
本来Open Access是好事情，但是大佬们顺便又干了一件事情：搞了一个叫PLoS ONE的期刊。大佬们觉得CNS这些虽然自己可以掌控，但是也不是绝对的，如果有个期刊，不让审稿人刁难，只要是正确的就简简单单直接发表该多好啊。于是他们在PLoS系列中整出来这个PLoS ONE。结果也不知道是他们计划中的，PLoS ONE成了大金库，赚的钱远远高于运营的成本。算一算：每一篇文章一两千美元（记不清当年多少了），一年发2万篇，就是几千万了。由于Open的好引用，加上大佬们的高质量文章被CNS拒了的就直接去，PLoS ONE这个地摊级别的新“学术小贩”的影响因子一度高过百年老店JBC。（打假大师方舟子读博多年，最好的文章就是JBC哦！）于是更多人投稿PLoS ONE，他们一下子就盆满钵满了。
这下可搞出商机来了。Nature不高兴了：我们是皇家，怎么能让你们赚钱？！于是推出Scientific Reports，和PLoS ONE抢生意。其他各出版社有样学样，纷纷推出自己的“姐妹刊”。办一个新的Open Access的期刊几乎没有任何成本，于是成百上千的这样的期刊涌现，但是都没有Nature旗下的SR赚钱多。后来CNS皇族又觉得低端的影响因子3-4的地盘不够大，要在影响因子10左右的地方圈钱，于是Nature推出Nature Communications，Cell推出Cell Reports，Science推出Science Advances。收的发表费用大约5000美元以上。这些期刊，由于有皇家期刊的稿源，影响因子一下子就上了10左右。CNS的名字好，又有高影响因子，很多作者是趋之若鹜。食髓知味，CNS在“高端”收费期刊的路上狂奔。最近Cell出版社一下子推出很多强制Open的杂志，收费基本上都在5000美元这个级别上，其中两个要9000美元，简直就是抢钱。
这下子传统专业期刊不好受了，影响因子一路下跌，很多不强制Open Access的都跌到10以下 了。那么这些新贵们的影响力（reputation）怎么样呢？我个人认为它们不如那些以前正规的传统期刊，比如Journal Neuroscience，Genome Research，Genetics等。我有精心打造的好文章，肯定先投传统的，进不去再试Nature Communications。但是不同的人的想法不一样。有一点是肯定的，如果回中国去找工作，肯定是影响因子为王了。而且毕竟名字里面有CNS，外行听上去也很好听。（所以大家不要跟着我走！）
在世界的东方，中国崛起了。有几个中国的期刊影响因子都出人意料的高，如Science Bulletin， Cell Research，都超过10了。这些期刊我不懂，不敢妄议；但是在西方圈子里面，它们的声望还有待大家接受。我知道在美国有人发Cell Research没有过终生教职评审的（Associate Professor with tenure）。如果是在西方有名的10分的其他期刊，可能会认可度好一些。
中国人一旦搞明白了系统，就会把它用到极致。在低端，仿造PLoS ONE，中国人搞出了两个收费期刊系列：一个叫MDPI，一个叫Frontiers（Frontiers好像不是中国人创办的，但是现在很多编辑都是中国人。）这两个系列办了无数的灌水期刊，文章质量惨不忍睹，但是很多影响因子比5高。这是什么回事呢？说实话我也看不懂，这里仅仅是一个猜测：中国系统里面很多拉帮结派互相引用的，常常是无关的文章也“刷引用”。（因此出现曲阜师范数学系引用数超过清华复旦的笑话。）MDPI的灌水杂志，有中国人刷，就能保证影响因子。相反的，JBC，J Neuroscience这些严肃期刊，中国人进不去，影响因子就不能保证了。这些中国人控制的水刊，我个人认为，即便影响因子超过传统期刊，其水平也差了一大截。大家千万不要贪图它们的影响因子，把自己正儿八经的文章投过去。当然如果你就是要灌水（如本科生毕业设计），那能发的地方多得是，PLoS ONE，SR，MDPI或Frontiers 其实都无所谓啦。
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曾经认为Nature Neuroscience、 Nature Medicine等都是很不错的期刊，发表的文章肯定都是很牛逼的，后来才知道不一定。 有时候，"It is not what you know, but who you know”? 一些大牛的学生，或者朋友就是这些期刊的编辑,大牛在这些期刊发表论文就是小菜一碟呐...
我个人觉得中国的学术大跃进要对此负主要责任。现在要想回归找个教职， 没有几篇IF20以上的文章估计的去三线学校了。我们系有一个学生comprehensive考了两次，结果发了一篇Science，最近评上了青千，回一所985当正教授了。有意思的是他的导师（洋人）尝到了甜头，从中国招了几个小镇做题家，好家伙productivity连上几成楼。想提前升正教授，系里直接给拒了。最近几个大基金不是没有renew,就是拒了。有时候群众的眼睛还是雪亮的。
我记得小时候听过一个故事，当年放高产卫星，有一个公社书记怎么努力也达不到万斤 （by the way, 袁隆平的杂交水稻好像只有1200公斤），经常被县里批评，没办法让手下去隔壁公社打探以下。会来后告诉书记，别人是这么这么搞定的。书记说那我们也搞一搞吧，结果堆了给一万斤。第二天一大早敲锣打鼓去县里报喜（40岁以下的同学注意了，当年叔叔阿姨可没有微信).结果刚出门，邻居也敲锣打鼓出来了。一问别人十万斤。
本枪在国内的导师是老院士。有一次会母校，系里请客，席间大家谈到现在系里对新老师IF的要求。我悄悄的问院长（我同学）， 如果xx院士现在来申请，你们能不能给个讲师？
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深度一来就不同凡响，对文学老城开始改造，上了一个档次。
在Neuron和Nature Neuroscience之间选择 我个人喜欢Neuron，感觉虽然Nature Neuroscience分数比Neuron高挺多了现在 但经常在NN上有看到文章会感叹这种文章为啥能发NN？可能我对文章的衡量还没到NN编辑的水平 ：）Neuron感觉更严谨一些 Science Advances我审过也投过 身边有大佬经常发 感觉是一个大佬俱乐部 但文章水平上下参差比NC或CR还要大 有很多大佬关系文章
您医学院有比较明确的政策能cover 12 months salary regardless of grant？这种医学院很少见的 很多系都是soft money based职位 一旦整个系的R01 income不够大多是很难cover全部工资吧？感觉只有非常有钱 clinic收入非常高的系才能像你说的provide 12 month hard money（我只听说过一个，是一个特别好的医学院） 您还自称在二流的医学院 能cover 100% effort我可不觉得会是二流医学院 ：）
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回复 '深度思考' 的评论 : 不同领域的Frontiers档次肯定不一样，我和您不在同一领域，所以不知道何为BMC，所以抱歉无法回答。谢谢您的分享！
他们定价9000可能也算没有办法 以前听说过如果Nature要完全open access 一篇文章必须要收好几万 因为据稿率太高 编辑时间都花在被拒的文章上了 nature一年才发1000篇不到 他们算下来是很难完全open access的 定价越高的杂志表明据稿率越高 越selective ；）不过你也说的对 大部分实验室其实也不愿意花9000去发文章的 这些新杂志最终影响力能怎么样还真不好说
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嗯 我们是实验神经科学 所以看看你们计算背景neuroscience挺有意思的 又算同行又差别很大 呵呵 Cell Reports Methods前面也挂Cell 质量应该还行？杨教授可以看看这杂志上发表的文章估量一下 主流的10分杂志是很难发啊 Cell Reports也算这个档次的了 不知道后面加一个methods最终会到什么档次
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Frontiers比BMC还真类似，我觉得是同级的。 但Frontiers扩张太厉害 光Frontiers neuroscience就有无数种更细分类的system neuroscience，cellular neuroscience, aging neuroscience, behavioral neuroscience. 这样搞法我觉得质量参差不齐会非常夸张 感觉只能边角料小课题的东西可以试试投他了 否则好东西发那里 这么多奇怪的杂志名字都把人头搞昏
Genomics前面可是带“Cell”的 作为亲儿子“子刊” 收$9000还是便宜你的 ：）
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回复 'ananatl' 的评论 : Cell的两个叫Patterns 和 Genomics。都是9000的。如果今天投，有打折；但是长期价是9000.
Frontiers 系列我有一定了解，是德国的现在世界顶级的Springer和中国高教出版社合办的，在不同领域都有一本期刊，原来是将中国期刊里的文章译成英文。但由于翻译质量问题很大，这类文章在海外无任何市场。所以这一系列走向了发表原始（传统）论文的道路，也有匿名评审等尽量和国际接轨的实践。我和您在不同领域，对Frontiers 系列的了解是因受邀出任主编。尽管我没有接受，尽管Frontiers文章质量是有问题（所有期刊都有类似问题），但似乎不值得被贬为“灌水期刊”。
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感到问题更大的是科研本身。尤其是，科研创新的最主要步骤，在西方一流学校司空见惯的，所谓“建立假说-验证”,而非“东试西试”。正因为不言而喻，很少在文献中看到研究的思考过程。久而久之，大家就误以为“东试西试”，“砸钱碰运气”，是科研的主要出路。这可能是，国内外多数高校与西方一流大学之间的最根本差别。而评估系统的不合理等，都只是外因。前苏联的科研成果就是例证。
至于期刊，Frontiers可能是受领域和编辑影响。我的领域很多文章还是很好的。MDPI那是真的不行。
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杨教授评价的还是很到位的 特别是“水刊即便影响因子超过传统期刊其水平也差了一大截”。而且我也赞同原因分析，感觉现在研究也都是根据方向 水平 国家等等部落化了，一个每年发100篇水文章的实验室/小团体第100篇把前99篇都引用一遍 累计下来“影响因子”也不得了 但也就是100篇水文章 其实并没有什么“影响力”
Cell系统有强制出$9000的杂志了？我靠 这么凶残 哪个？
杨教授有文章能去Nat Commun的会先送JN？这个要佩服的 我貌似做不到 呵呵
我觉得Frontiers的reputation要比MDPI好挺多的 Frontiers他们取了一个很大的巧就是最后文章接受之后把editor和reviewer的名字都强制公开的 这样研究人员自己名誉搭上去不会太离谱 等于让这么多科研人员给Frontiers站台了 这杂志发的人还是挺多的 我好多同事都发这个 MDPI还有其他一些开发出版社感觉更low 一点
另外我再补充一个“Nature Index journal“ 能上这个index也就是得到大佬首肯的了 比如JN，JBC 和Genome Research都在这个list 上
对了，杨教授有机会谈谈PNAS和eLIFE的投稿经验啊！ ：）
Cell系统有强制出$9000的杂志了？我靠 这么凶残 哪个？
杨教授有文章能去Nat Commun的会先送JN？这个要佩服的 我貌似做不到 呵呵
我觉得Frontiers的reputation要比MDPI好挺多的 Frontiers他们取了一个很大的巧就是最后文章接受之后把editor和reviewer的名字都强制公开的 这样研究人员自己名誉搭上去不会太离谱 等于让这么多科研人员给Frontiers站台了 这杂志发的人还是挺多的 我好多同事都发这个 MDPI还有其他一些开发出版社感觉更low 一点
另外我再补充一个“Nature Index journal“ 能上这个index也就是得到大佬首肯的了 比如JN，JBC 和Genome Research都在这个list 上
对了，杨教授有机会谈谈PNAS和eLIFE的投稿经验啊！ ：）