一个衣衫褴褛的植物学家
植物学家写的科普、时评、游记、散文
前段时间，微信里有两位国内植物学博士朋友，跟我分享一篇推文，题目是“版纳植物园基于全基因组数据解析新型冠状病毒的演化和传播”。结论是，据最新的结果，新冠病毒的来源可能有鬼。其中一位朋友还信誓旦旦地说：“如果最后证明了病毒源头在美国，那就大大的悲剧了！”
我和他常在微信里争论，类似于“社会主义好，资本主义糟”这样的话题。我当即反击：“枉你还学植物分类！这种弱智的话都敢相信！”朋友坚持：“拭目以待咯，反正没有最终定论，一切皆有可能！”
今天在刘教授的“亚美艺术联盟”群里，看到有群友很气愤地提到：“钟南山被吹捧上天了。现在他说病毒根源不是中国，暗指美帝！”我以为，前段时间甚嚣尘上的“美国阴谋论”应该没有市场了呀！没想到，这样的判断出自咋们院士之口。钟院士前段时间预测拐点，屡屡误判，已经让人大跌眼镜了：他最先说，拐点2月初就会来临；等快到2月初了，又改口说2月中；等快到2月中了，又改口说2月底，。。。想不到，钟院士也持有类似于我那两位植物学博士朋友的观点。
有位群友把相关的推文分享给我，这篇推文是一个叫“无冕财经”的作者写的、题目为“钟南山最全讲话：疫情不一定发源在中国！有信心四月底基本控制”。我看了录像，钟院士的意思是：对疫情的预测，我们首先考虑中国，没考虑国外，现在国外出现一些情况，疫情首先出现在中国，不一定是发源在中国。
两位拥有植物学博士学位的科学家和钟院士都暗指或者相信，新冠病毒的源头不一定在中国。言下之意，源头可能在美帝。可见，这种观点现在在大国成了主流。
我又想起，前段时间有数篇影响很大的推文的主流观点是，美国这个冬天的流感死了1.4万人，其实不是死于流感，而是死于新冠病毒；那么，很显然，新冠病毒源于美国。这种谣言，还有“日本媒体”的支持，但网上有很多人反击过，不值一驳！首先，美国统计的方法跟中国不同，中国的流感致死率大约是美国的2-3倍（主要原因有二：医疗条件美国更好；美国40%左右的人打流感疫苗，而中国只有2%左右）；再次，新冠病毒和流感病毒感染人后的症状确实类似，两者都是RNA病毒，但两者从分类学角度看，完全没有多少亲缘关系，它们在分类上的门、纲、目都不同，差异太大，很容易区别。美帝的科学家们不至于那么弱智。再说，就算川普政府想隐瞒什么秘密，美帝有强大的私立媒体，作为皿煮的第三力量，秘密不容易被隐瞒。在医学上，一个简单的流感快速核酸扩增试验（A rapid nucleic acid amplification test (NAAT) for influenza），就可以搞定，很容易。
钟院士等“科学家”暗指，新冠病毒的源头可能在美帝的重要“科学依据”，是最近一位西双版纳植物园的Yu博士，也是植物学家（看来植物学家喜欢跨界搞点名堂！）及合作者投出去的一篇还没有审稿的在线稿子：
http://www.chinaxiv.org/abs/202002.00033
Yu博士本人根据自己的英文文稿，写过一篇中文的推文，名曰“中科院重磅研究：新冠病毒12月8日和1月6日发生过2次明显的种群扩张 ！11月下旬或已人传人，华南海鲜市场并非发源地”。
这些作者用种群遗传学population genetics的方法，分析新冠病毒93个全基因组数据里的单倍型haplotype的关系，来推断新冠病毒的来源。首先要承认，这种应用很有新意，他们得出的一些结论，有一定的说服力。这里的给“美帝是源头”提供“证据”的是，他们推测的两个“古老的” 单倍型H13和H38，其中H38只存在于美国的首例新冠病毒病人。这就暗示，有可能这个美国人，把病毒带到了武汉。但是这个人是今年1月15号才从武汉回到美国的。网上差不到，他说明时候回的武汉。就算他把一年一个月的休假全部用在呆武汉，也不会早于12月16号?。现在普遍认为，新冠病毒11月?中旬到下旬就开始了。他难道能把病毒隔空从?美国带到武汉？
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001191
从专业的角度看，Yu博士他们的论文还有一定的局限，他们自己也承认。
首先，mv1是假设中的消失了的祖先单倍型。这是否成立，还难说。
其次，他们推测的两个“古老的” 单倍型，H13和H38，之所以没有在武汉检测到，最大原因的可能性是，武汉病人的病毒取样不足，特别是最开始被感染到的病人。想想，很多人开始并没症状，可能一直都没症状，就过了。就算有政状的病人，大多数的病毒没有RNA序列。所以，Yu博士他们的结论应该改为：“新冠病毒的源头不一定是武汉的华南海鲜市场，也可能是武汉的华南海鲜市场。”
从GenBank里的新冠病毒的基因组数据看，有很多样是在今年2月份测的。在这些样里，当然很难找到“古老的” 单倍型。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore?term=sars-cov-2&cmd=DetailsSearch
就算他们的取样是完美的，文中说“新冠病毒的源头不一定是武汉的华南海鲜市场”，但无论如何，他们也没法下结论说，新冠病毒的源头就是美帝。相反，Yu博士的推文中有一句话：“对“古老的”单倍型H13和H38的病毒样品溯源发现分别是来自深圳的病患（广东首例）和美国华盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记录表明应该都是2019年12月底至2020年1月初在武汉探亲期间被感染的。”他们认为，两个“古老的” 单倍型H13和H38来自于武汉。也就是说，病毒源自武汉。
根据Yu博士那篇中文推文，来判断“新冠病毒的源头就是美帝”，不止是对Yu博士的论文的过度解读（overinterpretation），而且是错误解读（misinterpretation）。
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