总统选举于1913年10月6日在宪法会议议场举行,由国会议员根据《大总统选举法》开会选举大总统。总统选举期间,由袁世凯手下伪装组成的公民团包围国会,叫喊“今日非将公民所属望的总统选出,不许选举人出会场一步”[1]。然而,在前两轮投票中,袁世凯仍然分别只得到471票和497票[1],不满法定3/4之票数。于是举行第三次投票,以第二次投票较多的袁世凯及黎元洪进行决选。结果,在出席的722名议员中,袁世凯得507票,超过法定的票数,当选中华民国第1任大总统[2]。10月7日,在同地点选举副总统,结果出席议员719名,黎元洪以610票,当选中华民国第1任副总统[3]。