对于许多有机反应而言，氧的存在比微量水的存在的危害性更大。如果一个反应没有按预想结果发生，那么应该确认一下体系中的氧是否已经除净，包括溶剂中溶解的氧气。对于某些特定的反应而言，溶剂除氧是非常必要的:
1. 超过120度的反应或者在80度以上长时间加热的反应。这些反应通常在密封管中进行，并且通常加热温度在溶剂的沸点以上，尤其是对于分子内的反应而言，如果反应期间颜色变黄或者变棕通常认为是由于氧的存在。高温的反应对氧十分敏感，甚至于在打开反应对样品进行TLC取样时带入的氧气也有可能破坏反应。
2. 有机金属反应。对于许多有机金属反应而言，需要提供一个无氧的环境(有时需要无氮的环境)。对于使用某些敏感的催化剂而言，进行10次冻干-抽泵-解冻的循环并不少见。
3. 自由基反应以及光化学反应：自由基物种往往能够与氧气发生反应，显而易见必须除氧。
4. 底物中含有硫醇、硫醚、磷化氢、富含电子的芳香族化合物等。加热溶剂通常会导致这类底物发生氧化反应，尽管在通常情况下这类化合物是稳定的。
3种常用溶剂除氧的方法
1. 鼓气(purging)
这是最简单但脱气效果最差的一种方法，适用于粗略的大批量溶剂脱气。该方法顾名思义，在溶剂中持续鼓入惰性气体(氮气或氩气)30min-1h。
惰性气一般通过一根干净的长针管通入溶剂。针管接在一个适配器或者尾部截断的空针筒上，这样便可配上Schlenk line的伸缩性橡胶或塑料导管。针管穿过橡胶塞插入装有溶剂的容器中，针头必须伸至溶剂底部。另外还要插入一根短的针管用以压力释放。
注意，气体流速不能太快以免溶剂过多蒸发。一般2-3个气泡每秒就足够了，而对于低沸点溶剂可以适当减缓。在使用这种方法的时候，需要注意的是要注意防止溶剂的挥发以及溶剂内水的浓缩。
2. 超声
这个方法比鼓泡法效果好，适用于为高效液相色谱（HLPC）和一些快速反应提供脱气溶剂。它包括在微真空环境（如室内真空）下溶剂的声波降解和惰性气氛再填充。这个过程须重复5-10次，每次溶剂的声波降解时间约为1分钟。
3.冰冻-抽气-解冻法
这是效果最好的脱气方法。它适用于小体积的溶剂（通常用于标准大小反应烧瓶的溶剂），包括冰冻、抽真空和解冻三个过程。将密封的Schlenk管中或者厚壁的密封试管浸入液氮中。当溶剂完全冷却后，打开活塞，对于对于瓶内抽真空2-3min(反应瓶依然浸入在液氮中)。关闭反应瓶，解冻直至溶剂完全融化。重复该过程，通常三次。最后一次过程中将体系内充满惰性气体。在Schlenk瓶中去除氧气的溶剂通常能保存1-2天。
