任兵表示:“这项名为‘HaploSeq’的技术将帮助医生们更好地评估个人罹患某种疾病的风险,从而为个性化医疗开辟道路。现在,花费5000美元、一周时间就能获得个人基因组测序的结果。在并不遥远的未来,每个人的基因组都将被测序,但这个美好的场景中也有不和谐之音。除了性染色体,其他染色体都拥有两个副本:分别来自父亲和母亲。现有技术无法对每个基因的这两个副本进行区分,从而给遗传分析蒙上了阴影。”
任兵指出,结合了分子生物学和计算生物学方法的最新技术解决了这个问题。这一方法使研究人员能快速确定哪些遗传变异出现在同一个基因上,从而确定其来自父亲还是母亲。
研究人员将继续对这一技术进行深入研究。他们表示,这一技术的应用领域非常广泛。
首先,新技术有助于研究人员更好地评估某个人罹患某种疾病的风险,从而推进个性化用药的发展。另外,新技术或能帮助科学家们分析人类的迁移情况并通过 DNA 序列来帮助其“认祖归宗”。
任兵说:“从理论上讲,你可以将自己的 DNA 序列同邻居的 DNA 序列进行对比,并询问你们是否有共同的近亲。但新技术可以研究每个个体以及个体间的关系。一旦我们获得更多个体的数据,我们就能精确地确定他们之间的关系。另外,这一技术也将促进正在进行的国际人类基因组单体型图计划(简称 HapMap 计划)的发展。HapMap 计划的目的是确定和编目人类遗传的相似性和差异性。”
新技术的另一个优势在于,它建立在常用测序技术的基础上,因此,临床医生和研究人员很容易上手。
原文检索:
http://www.sci-news.com/genetics/science-haploseq-dna-mother-father-01517.html
Siddarth Selvaraj, Jesse R Dixon, Vikas Bansal & Bing Ren. Whole-genome haplotype reconstruction using proximity-ligation and shotgun sequencing. Nature Biotechnology, 03 November 2013; doi:10.1038/nbt.2728