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对新冠Omicron突变株没有必要惊恐

(2021-11-27 19:59:43) 下一个


这是我对新冠Omicron最原始的反应:“虽然南非新突变株是Delta以来的最大挑战,但是能够超过Delta的突变并不容易产生,新冠多聚酶的纠错功能十分强大。专家也认为南非新突变株完全逃逸疫苗和治疗用中和抗体的免疫力的可能性很低,况且辉瑞说一旦确实需要,他们百日就能生产出针对新突变株的疫苗,所以不必太紧张。

我已经被多人问到此新的南非突变株,已经造成今天华尔街股市大迭,但是我认为似乎是过度反应。因为根据这些专家在Nature的发言,我们现在对此突变株的传播速度、致病性或逃避疫苗的能力都不清楚,所以大家不要惊慌。南非病例相当低,虽然在香港出了此突变株,但远不是主体,美国没有报道。至于说它在S蛋白中有30个突变,也不是可怕的数字,要看氨基酸突变在哪里?是否在RBD等等。我们知道S蛋白非常大,拥有1273个氨基酸,30/1273=也只有2.3%。辉瑞曾经对RBD的不少氨基酸做过突变实验,证明保护效力良好。????[握手][强]”

现在让我逐步展开,看看上面的直觉(gut feeling)是否靠谱。


这WHO也是一笔糊涂账,以前说是以希腊字母排序的,现在不这样做了。让Omicron趁机扬名,借助病毒的繁殖力[偷笑][呲牙], 我当时建议命名为WH Virus也是希望江城可以更有名些。转:“Omicron在电力行业非常知名,是做测试装置的隐形冠军,现在会很快成为世界知名企业[呲牙]”

原来是中国皇帝名讳。转朋友解释:“世卫组织消息来源向记者证实,命名新变种病毒时希腊字母Nu(牛)和X_i(赛)被刻意避开。消息人表示,跳过Nu是为了避免与发音类似 "new"混淆,跳过X_i是为了"避免对某个地区的污名化"。来自南非的新冠病毒新变体命名为奥密克戎(Omicron),跳过了二个希腊字母[呲牙]”


读了一圈快迅,现在作些更新,因为不断有朋友问我。Omicron的突变大概有50多个,其中30个发生在S蛋白上,虽然只占整个S蛋白的2.3%,但是最值得警惕的是这30个突变中的15个发生在RBD (受体结合结构域),作为对照Delta突变株只有2个氨基酸突变在RBD。因为RBD是新冠病毒的S蛋白与ACE2结合的地方,然后通过水解酶进入细胞,所以任何在RBD的突变都会使疫苗和治疗用中和抗体面临挑战。因为至今只有这个主导的受体,所有疫苗都是赌的它,还真被辉瑞和Moderna赌对了。在我们对新冠病毒很不了解的时候,Moderna的mRNA序列是在托尼·福奇的办公室拍板的。

仔细分析Omicron的所有突变发现它们是Alpha, Beta, Gamma和Delta的集合体,自身又加进去了些突变。初步推测这是病毒在机体长期存留后不断变异的结果,很大的可能是在免疫功能低下的个体发生的,像癌症病人、移植或自身免疫病使用免疫抑制剂的病人。他们无力清除新冠病毒,病毒则在他们的机体内大量突变,科学家在Cell发表过类似病例。但是这里必须指出,虽然50个氨基酸突变貌视很多,但是与艾滋病毒和流感病毒的巨量突变相比,仍然只是毛毛雨。



我们没有必要过分惊恐,美国两大公司宣称三个月就能制备出新疫苗。我们至今不知道Omicron的传染力,英国报纸说它的R0只有2,也就是一人传二人。我们知道在新冠早期,美国Los Alamos国家实验室测出的R0为5.7,Delta更是高达6-7,号称几秒钟就能传染。当然R0随很多因素影响,并不是绝对指标。

现在美国仍然没有病例,我们应该感谢这次美国政府迅速采取行动,将在11月29日停止来自南非等八个非洲国家的航班。这里我们需要给南非和首发国家Botswanan的医生科学家功劳,他们及时发现和向全球通报了这个新突变株。

现在Omicron己经扩展到各大州,荷兰测定了来自南非的两个航班,发现高达10%的旅客是新冠阳性(61/600),不知这些阳性病例里多少是Omicron突变株。现在发现了2位Omicron阳性的香港居民,他们全部是完整疫苗接种者,其中一位可能是在隔离旅店感染的。这些信息必将会使国内的隔离措施进一步趋严,大家做好准备。这也是可以理解的,对于一个疫苗所刺激抗体滴度很低的国家,这是没有办法的办法,中国现在没有达到与病毒共存的条件。

我们处在需要英雄的时代,而发现Omicron突变株的南非医生Angelique Coetzee就是这样的一位英雄。这位家庭医生在自己繁忙的临床诊疗中发现了一例可疑病例,在11月18日,她发现四位类似表现的病人后报告了国家疫苗委员会。相关部门测序后发现,Omicron突变株正在南非这个疫苗接种率奇低(只有24.1%)的国家流行。

这位身为南非医学会主席的白人医生拥有33年临床经验,她发现Omicron发生在不同背景的年轻人身上,甚至还有一个6岁小孩因为心率增快而被诊断,他们都没有失去味觉和嗅觉。与Coetzee医生以前的新冠病人相比,他们的症状有所不同,但是一般都是相当轻微的。她现在总共诊断了感染Omicron突变株的24位年轻人,他们都表现为非常疲惫,大约一半人没有接种疫苗。这是对Omicron突变株的好消息,当然病例数量还不够。

这位家庭医生再次重声自己的病人都是健康的年轻人,不知道这个突变株对老年人或拥有基础疾病的病人的影响如何?与西方发达国家不同的是,南非的老年人的人口比例非常低,年龄超过65岁的人群只有6%。

在这里我想传递的核心信息是,我们需要对Omicron突变株警惕,但是她的危害性还远没有达到Delta当时所造成的震撼程度,所以千万不要惊恐。

黑色周五在华尔街卖出股票的散户应该是亏总了,又不找我咨询一番,交点手续费就行。最后讲一个实话,华大著名病毒免疫学家Michael Diamond 实验室有各种各样的新冠突变株,他们开始都涉及,但是如果有些突变株消失了,他们就放弃不做,但愿Omicron只是让我们白紧张了一场。

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阅读 ()评论 (13)
评论
Dalidali 回复 悄悄话 谢谢科普!
今天应当有更多新消息吗?
大荣确 回复 悄悄话 风森读书声 发表评论于 2021-11-28 08:29:03
24个年轻人一半没有注射疫苗,换言之就是另一半都注射了疫苗,那么是否简单理解为疫苗对特定年轻人群的新病毒防控力仅50%左右
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相关部门测序后发现,Omicron突变株正在南非这个疫苗接种率奇低(只有24.1%)的国家流行。
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以上两种情况反而令人更加担忧Omicron突变。
年轻人本来接种率就低,肯定不足24.1%,然而接种过疫苗的年轻人反而占确诊总数的一半。与76%未接种疫苗的人群相比,接种过疫苗的人群感染Omicron的几率反而是未接种者的三倍多。并且不管接种与否,患者的症状几乎一样。所以注射疫苗不仅不能降低感染率,反而会更容易感染上Omicron变种,而且也不能减轻症状。
红米2019 回复 悄悄话 从症状的细微差别判断出新变种确实牛,但本来新变种的出现不是应该通过在感染者中抽样测序来监控吗?一个医生就遇到好几例,这个比率不低了,抽样也不应该miss掉吧。
春暖花开2016 回复 悄悄话 谢谢科普!
markyang 回复 悄悄话 华尔街是高位风险,随时可能下调,不奇怪
注册很麻烦 回复 悄悄话 谢谢科普,但愿如你所说,否则这世界要灭亡了
davidinchina 回复 悄悄话 我在红州的州大做教授,这学期我雇学生做助理,我面试学生的时候在问完问题后,总是装做不经意的问:are you fully vaccinated? 有60%的学生没有打过任何疫苗。
玉器晚成 回复 悄悄话 感谢分享!喜欢你的科普文章,客观,易懂。期待你对Omicron跟进的文章。
风森读书声 回复 悄悄话 24个年轻人一半没有注射疫苗,换言之就是另一半都注射了疫苗,那么是否简单理解为疫苗对特定年轻人群的新病毒防控力仅50%左右,中老年人群当下没有样本对照
guoke001 回复 悄悄话 感谢科普,
最关心的就是打疫苗,打两针肯定不够,要第三针,明年马上可能还有第四针,第五针?
FollowNature 回复 悄悄话 华为尔街是借机割韭菜。
蓝山秋色之红叶静美 回复 悄悄话 谢谢分享,RNA病毒的特点应该是比一般的DNA病毒突变容易很多,一天世界上没有控制或者消灭病毒传播,就要好好坚持抗疫吧,疫苗口罩和消毒。当然,生活尽量正常,工作学习也尽量正常,注意保持社交距离,少室内聚集。
回首前尘 回复 悄悄话 挺有意义的科普,虽然说的理论复杂了一点,道理还是说清楚了,今后的几个星期要密切关注这个病毒的发展
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