个人资料
雅美之途 (热门博主)
  • 博客访问:
归档
正文

英国剑桥提供了新冠不是源于武汉的证据吗?

(2020-04-10 11:08:41) 下一个

粗读了一下这篇倍受关注的来自英国剑桥的论文,这是我见到的可以供讨论的新冠可能不是源于武汉的科学证据,发表在今天的《美国科学院院刊PNAS》上。根据基因树分析,作者认为新冠存在A, B, C三大类,A和C类存在于美国和欧洲,B类存在于中国武汉。虽然A类存在于有武汉生活史的美国人中,但是A类大约有40%存在于武汉或中国人中。

必须说明这只是根据极个別基因突变造成氨基酸改变的数学模型推演出来的,并且是首次应用到病毒学中,当然PNAS是一流杂志。他们分析的基础是从2019年12月24日至2020年3月4日的基因组测序,从而将它们分成A, B和C三大类型,其中A类是最原始的,但是A类虽在武汉人中存在但不是主要的类型,A类却存在于在武汉生活过的美国人中。

武汉的主要基因型是B, 在东亚多见,作者认为B来源于A,而C又演变于B。C主要存在于欧洲(法国、意大利、瑞典和英格兰), 也存在于日本和新加坡等亚洲国家。我不明白他们在文章中为什么那么强调A的美国源性,而那图里A的美国人很少,A是相当的混合组成。

武汉B类基因呈现低突变态式,它只有突变了才能向外扩散,并且需要从免疫学或环境上突变才能适应广大的东亚人口。作者说这些话时完全是在猜测,等于沒说,或者胡言乱语一番,因为没有任何实验证据支持,我不知道剑桥人为什么这样引申自己的推断。

这篇论文当然是一家之言,三个作者都是Forster家的亲戚。两点存疑:首先,他们为什么用蝙蝠的基因组作为根序列,而不用复旦张永振帖在NCBI的新冠基因序列作为根序列?另外他们也承认这是首次将此考古技术应用到病毒学上。

[ 打印 ]
阅读 ()评论 (32)
评论
cng 回复 悄悄话 显然楼主不懂怎样解读进化树。

这篇文章,蝙蝠跳进人类的节点就是中国样品,黄色。这证据直指病毒源头是武汉,至少是中国。
luck86 回复 悄悄话 如果病毒来源在美国,为什么美国大爆发晚于中国,甚至欧洲。不要说美国把肺炎当成流感,那么现在的大爆发也应该就是流感了。不要拿极少数个例说事。逻辑总是要讲的。
24桥 回复 悄悄话 博主,我想请教2个问题:1)新冠基因库已经上传3000多基因序列,为什么这篇文章只选了160种,是依据什么原则选的?2)除了sars和cov-19,历史上还有源于蝙蝠的病毒传染给人类的例子吗?科学家们发现了多少种蝙蝠冠状病毒?除了研究咱中国的蝙蝠,有研究外国蝙蝠的吗?怎么那么巧,sars和cov-19都源于中国的蝙蝠?难道只有咱中国的蝙蝠最毒?
英国那些事 回复 悄悄话 回复 '清漪园' 的评论 : 剑桥的分析本身就没有建立在完整数据上,有何可信度?看看财新的这篇报道(国内已被删)https://matters.news/@LittleKui/%E6%96%B0%E5%86%A0%E7%97%85%E6%AF%92%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%BA%AF%E6%BA%90-%E8%AD%A6%E6%8A%A5%E6%98%AF%E4%BD%95%E6%97%B6%E6%8B%89%E5%93%8D%E7%9A%84-bafyreidznzhmd6ytnnacbz27xy6pqq2b3o45shbiw3frzhinubi7eugyue
常态 回复 悄悄话 按照美国欧洲目前爆发的情况看,有谁会认为他们居然能延后半年才爆发?
倒是天朝,用了杀"敌“一万自损10万的孙子兵法,反正,多难兴邦,代价你出。
fyuanster 回复 悄悄话 回复 '我不是愤青01' 的评论 : 怀疑有用吗?还不是你这样的人,天天散步阴谋论吗。承认武汉是源头有那么难吗!
fyuanster 回复 悄悄话 回复 'XYZ94538' 的评论 : 扯淡,香港早就报道,中国官方的报道是11月17号武汉出现了已知的第一例病例。流感和新冠和传染性和死亡率都不是一个数量级的,你以为美国医生都和你一样傻分不清吗?到现在你还相信阴谋论, 非傻即坏。
XYZ94538 回复 悄悄话
美国许多人回忆去年11月份,12月份得的“流感”,其症状与冠状病毒症状一致,还有一医生测试了自己已经带有冠状病毒抗体,说明自己以前得的不是流感而是冠状病毒症。

还有前天美国各大主流媒体各大电视广播新闻网报道美军情报机构曾在去年11月下旬准确预报武汉将有大瘟疫,而那时武汉还没有任何病例,这更加增添了事件的诡秘。



丁丁猫和熊猫猫 回复 悄悄话 慢慢奔溃额
BeagleDog 回复 悄悄话 可能是国内的网民英文太烂?
郁二光 回复 悄悄话 任何这类文章对于追责中国已经无济于事了。甚至以后有实锤证据病毒起源不在中国都没有用。关键是疫情起源于中国而中国隐瞒疫情,且没有向WHO和其它国家提供可参考信息。隐瞒疫情和感染人数,通过WHO误导全世界。使得全世界失去了宝贵的把疫情控制在最初阶段的时间。

现在各国政府不会再关注病毒的起源问题。那是一本糊涂账。交给科学家互相争吵去吧。那是他们擅长的。而且我相信是不会有结果的。中国政府就是死猪不怕开水烫。要钱没有,要命来拿!西方国家的索赔举动不是真正以为中国会赔偿,而是在道义上压中国。好为其它打压中国的行为建立法理依据。中国这次玩完了!
鸽哨 回复 悄悄话 "这篇论文被国内病毒阴谋论翻译成不是来自于武汉的病毒,欺负中国人英语不好吗?" +1
红米2019 回复 悄悄话 还没看这篇,不过与之前版纳和稍后上海的文章有很大区别吗?其实光看早期的序列无法判断究竟谁先谁后,必须加入两个条件,第一是采用云南蝙蝠序列作参考,但我们都知道云南蝙蝠不是直接源头,用其为参考有很大不确定性。第二必须参考流行病学信息,简单说就是病例发生的时间先后和传染关系,但这样一来,再推论病毒起源就成了循环论证。所以这类研究我觉得很难得出什么结论。
Justness 回复 悄悄话 哈哈,司马昭之心路人皆知!
清漪园 回复 悄悄话 科学界不乏要独树一帜,一心成名的人。至于剑桥这篇文章的论述是否成立,需要全球科学界的英才们断定。
valore 回复 悄悄话 There are two subclusters of A which are distinguished by the synonymous
mutation T29095C. In the T-allele subcluster, four Chinese individuals (from
the southern coastal Chinese province of Guangdong) carry the ancestral
genome, while three Japanese and two American patients differ from it by a
number of mutations. These American patients are reported to have had a
history of residence in the presumed source of the outbreak in Wuhan. The C-
allele subcluster sports relatively long mutational branches and includes
five individuals from Wuhan, two of which are represented in the ancestral
node, and eight other East Asians from China and adjacent countries. It is
noteworthy that nearly half (15/33) of the types in this subcluster, however
, are found outside East Asia, mainly in the United States and Australia.

注意这句话:“four Chinese individuals (from the southern coastal Chinese province of Guangdong) carry the ancestral genome, while three Japanese and two American patients differ from it by a number of mutations.”

也是奇怪,武汉上传的样本并不多,和患病人数相比。
wyhz9311 回复 悄悄话 Sample of 160 cases is definitely too small to be statistically meaningful. Considering the current population of Covid-19 patients has reached over 1.6 million, I do not see any significance of this research.
我不是愤青01 回复 悄悄话 不用大家揣测,美国人自己也会怀疑美国可能最先有新冠肺炎病例
Rosaline 回复 悄悄话 Xyz 先生,我在前面已经回答了您的问题。

XYZ94538 回复 悄悄话
美国许多人回忆去年11月份,12月份得的“流感”,其症状与冠状病毒症状一致,还有一医生测试了自己已经带有冠状病毒抗体,说明自己以前得的不是流感而是冠状病毒症。

还有前天美国各大主流媒体各大电视广播新闻网报道美军情报机构曾在去年11月下旬准确预报武汉将有大瘟疫,而那时武汉还没有任何病例,这更加增添了事件的诡秘。


Rosaline 回复 悄悄话 谢谢雅美先生。我们西雅图地区基本已经控制住了。Washington 的州长己将联邦给的500个呼吸机退回去了,并且将在市中心体育馆刚刚建好的野战医院也撒了,请去外州更需要的地方。
如今西雅图春暖花开,阳光灿烂。
雅美之途 回复 悄悄话 回复 'Rosaline' 的评论 : 谢谢!好久未见,祝一切好!
Rosaline 回复 悄悄话 我每天跟踪Twitter 上的Trevor Bedford, and 他的Nextstrain, 也坚信Nextstrain 的结果,因为Trevor Bedford 的分析样品量大,也与Helen Chu 博士一直合作,Dr.Chu收集了一千多份西雅图地区的冬季流感病毒样本。目前的结论仍然未变。一切起源于武汉。
cawan 回复 悄悄话 回复 'firecloud' 的评论 :

These authors only analyzed the first 160 sequences. Situation in Australia can be similar to those of WA and CA in the US: The early cases came from China, and the late cases are from US, Iran, and Europe. Nextstrain.org has the most updated information.
雅美之途 回复 悄悄话 回复 '晓龙东云' 的评论 : 就是想说不能证明啊,作者也说不能,只是有人想往这方面引伸。
wumiao 回复 悄悄话 这篇论文被国内病毒阴谋论翻译成不是来自于武汉的病毒,欺负中国人英语不好吗?
晓龙东云 回复 悄悄话 “A类大约有40%存在于武汉或中国人中”,既然有40%,怎么就能证明新冠不是源于武汉?不明白其中的逻辑。论文有没有提到各个国家的基因各有多少?如果中国的基因很多的话,B类很多中国基因也正常啊
firecloud 回复 悄悄话 cawan

那个传播路径图显然是错的,澳大利亚前两周就说了他们的病毒是美国传过去的
iask 回复 悄悄话 https://www.youtube.com/watch?v=XMJ0EmMfb3U
iask 回复 悄悄话 Search on youtube: "The first documentary movie on the origin of CCP virus(Coronavirus)"
playnice 回复 悄悄话 如果能得出这样的结论,真是傻了。
cawan 回复 悄悄话 If we go to nextstrain.org to look at the sources of the sequencing data, we can see the submissions from Wuhan are rare and very few were submitted after early February. Would it be possible that "they" only sequenced/submitted sequences related to the seafood market, or just group B to mislead the rest of the world? Even though the authors use RaGT13 as the reference, which is in the hands of a Wuhan research group, this paper does NOT say the virus is originated somewhere else.

Dailymail reported the publication of this paper and the recent discoveries by two American teams. Figure in the paper clearly shows that all three, A, B, and C started from Wuhan.

https://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-8204255/There-THREE-separate-types-coronavirus.html
[1]
[2]
[尾页]
登录后才可评论.