中国医院的一流专科代表了该专科的顶尖水平，反映了中国在该专科领域的临床实力和学术声誉。复旦大学医院管理研究所从2010年开始，每年推出上一年度的《中国医院最佳专科声誉排行榜》和《中国最佳医院排行榜》评比。这里收集的研究所2012年发布的.
| 病理科 | 医院 |
| 1 | 复旦大学附属肿瘤医院 |
| 2 | 北京协和医院 |
| 3 | 四川大学华西医院 |
| 4 | 中国人民解放军总医院 |
| 5 | 北京大学第三医院 |
| 6 | 中山大学附属第一医院 |
| 7 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 8 | 南京军区南京总医院 |
| 9 | 第四军医大学西京医院 |
| 10 | 中国医学科学院肿瘤医院 |
| 传染科 | 医院 |
| 1 | 复旦大学附属华山医院 |
| 2 | 首都医科大学附属北京地坛医院 |
| 3 | 浙江大学医学院附属第一医院 |
| 4 | 中国人民解放军第三零二医院 |
| 5 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 6 | 南方医科大学南方医院 |
| 7 | 首都医科大学附属北京佑安医院 |
| 8 | 中山大学附属第三医院 |
| 9 | 上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心 |
| 10 | 北京大学第一医院 |
| 耳鼻喉科 | 医院 |
| 1 | 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 |
| 2 | 首都医科大学附属北京同仁医院 |
| 3 | 中国人民解放军总医院 |
| 4 | 北京协和医院 |
| 5 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院 |
| 6 | 中山大学附属第一医院 |
| 7 | 上海交通大学医学院附属新华医院 |
| 8 | 山东省立医院 |
| 9 | |
| 10 | 第四军医大学西京医院 |
| 并10 | 中南大学湘雅医院 |
| 放射科 | 医院 |
| 1 | 四川大学华西医院 |
| 2 | 复旦大学附属华山医院 |
| 3 | 北京协和医院 |
| 4 | 复旦大学附属中山医院 |
| 5 | 中国人民解放军总医院 |
| 6 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 7 | 中山大学附属第一医院 |
| 8 | 首都医科大学宣武医院 |
| 并8 | 中国医科大学附属第一医院 |
| 10 | 中国医科大学附属盛京医院 |
| 呼吸科 | 医院 |
| 1 | 广州医学院第一附属医院 |
| 2 | 复旦大学附属中山医院 |
| 3 | 北京协和医院 |
| 4 | 四川大学华西医院 |
| 5 | 首都医科大学附属北京朝阳医院 |
| 6 | 中国医科大学附属第一医院 |
| 7 | 中国人民解放军总医院 |
| 8 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 9 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 10 | 北京大学第一医院 |
| 风湿病 | 医院 |
| 1 | 北京协和医院 |
| 2 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 |
| 3 | 北京大学人民医院 |
| 4 | 中国人民解放军总医院 |
| 5 | 南京大学医学院附属鼓楼医院 |
| 6 | 中山大学附属第三医院 |
| 7 | 第四军医大学西京医院 |
| 8 | 四川大学华西医院 |
| 9 | 中日友好医院 |
| 10 | 第二军医大学长征医院 |
| 妇产科 | 医院 |
| 1 | 北京协和医院 |
| 2 | 复旦大学附属妇产科医院 |
| 3 | 浙江大学医学院附属妇产科医院 |
| 4 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 5 | 北京大学人民医院 |
| 6 | 四川大学华西第二医院 |
| 7 | 山东大学齐鲁医院 |
| 8 | 北京大学第一医院 |
| 9 | 北京大学第三医院 |
| 10 | 中国医科大学附属盛京医院 |
| 骨科 | 医院 |
| 1 | 北京积水潭医院 |
| 2 | 中国人民解放军总医院 |
| 3 | 北京大学第三医院 |
| 4 | 上海交通大学医学院附属第六人民医院 |
| 5 | 北京协和医院 |
| 6 | 四川大学华西医院 |
| 7 | 第二军医大学长征医院 |
| 8 | 北京大学人民医院 |
| 9 | 南京大学医学院附属鼓楼医院 |
| 10 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 精神医学 | 医院 |
| 1 | 北京大学第六医院 |
| 2 | 上海市精神卫生中心 |
| 3 | 中南大学湘雅二医院 |
| 4 | 四川大学华西医院 |
| 5 | 首都医科大学附属北京安定医院 |
| 6 | 南京医科大学附属脑科医院 |
| 7 | 广州市脑科医院 |
| 8 | 北京回龙观医院 |
| 9 | 武汉大学人民医院 |
| 10 | 深圳市康宁医院 |
| 口腔科 | 医院 |
| 1 | 北京大学口腔医院 |
| 2 | 四川大学华西口腔医院 |
| 3 | 上海交通大学医学院附属第九人民医院 |
| 4 | 第四军医大学口腔医院 |
| 5 | 武汉大学口腔医学院 |
| 6 | 中山大学光华口腔医学院附属口腔医院 |
| 7 | 首都医科大学附属北京口腔医院 |
| 8 | 广东省口腔医院 |
| 9 | 南京市口腔医院 |
| 10 | 中国医科大学附属口腔医院 |
| 麻醉科 | 医院 |
| 1 | 四川大学华西医院 |
| 2 | 北京协和医院 |
| 3 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 4 | 第四军医大学西京医院 |
| 5 | 复旦大学附属中山医院 |
| 6 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院 |
| 7 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 8 | 中国人民解放军总医院 |
| 9 | 中山大学附属第一医院 |
| 10 | 中南大学湘雅医院 |
| 泌尿外科 | 医院 |
| 1 | 北京大学第一医院 |
| 2 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 3 | 第二军医大学长海医院 |
| 4 | 中国人民解放军总医院 |
| 5 | 四川大学华西医院 |
| 6 | 北京协和医院 |
| 7 | 天津医科大学第二医院 |
| 8 | 中山大学孙逸仙纪念医院 |
| 9 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 |
| 10 | 浙江大学医学院附属第一医院 |
| 内分泌 | 医院 |
| 1 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 2 | 北京协和医院 |
| 3 | 中国人民解放军总医院 |
| 4 | 中南大学湘雅二医院 |
| 5 | 上海交通大学医学院附属第六人民医院 |
| 6 | 四川大学华西医院 |
| 7 | 中国医科大学附属第一医院 |
| 8 | 中日友好医院 |
| 9 | 北京大学第一医院 |
| 10 | 中山大学孙逸仙纪念医院 |
| 皮肤科 | 医院 |
| 1 | 复旦大学附属华山医院 |
| 2 | 中国医学科学院皮肤病医院（研究所） |
| 3 | 北京大学第一医院 |
| 4 | 中国医科大学附属第一医院 |
| 5 | 安徽医科大学第一附属医院 |
| 6 | 北京协和医院 |
| 7 | 第四军医大学西京医院 |
| 8 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 9 | 中南大学湘雅二医院 |
| 10 | 杭州市第三人民医院 |
| 普通外科 | 医院 |
| 1 | 北京协和医院 |
| 2 | 复旦大学附属中山医院 |
| 3 | 四川大学华西医院 |
| 4 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 5 | 中国人民解放军总医院 |
| 6 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 7 | 北京大学人民医院 |
| 8 | 中山大学附属第一医院 |
| 9 | 浙江大学医学院附属第一医院 |
| 10 | 南京军区南京总医院 |
| 神经内科 | 医院 |
| 1 | 北京协和医院 |
| 2 | 复旦大学附属华山医院 |
| 3 | 首都医科大学宣武医院 |
| 4 | 中山大学附属第一医院 |
| 5 | 四川大学华西医院 |
| 6 | 首都医科大学附属北京天坛医院 |
| 7 | 吉林大学第一医院 |
| 8 | 中南大学湘雅医院 |
| 9 | 中国人民解放军总医院 |
| 10 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 并10 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 肾脏病 | 医院 |
| 1 | 北京大学第一医院 |
| 2 | 南京军区南京总医院 |
| 3 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 4 | 中山大学附属第一医院 |
| 5 | 中国人民解放军总医院 |
| 6 | 复旦大学附属华山医院 |
| 7 | 北京协和医院 |
| 8 | 南方医科大学南方医院 |
| 9 | 第二军医大学长征医院 |
| 10 | 四川大学华西医院 |
| 神经外科 | 医院 |
| 1 | 首都医科大学附属北京天坛医院 |
| 2 | 复旦大学附属华山医院 |
| 3 | 四川大学华西医院 |
| 4 | 中国人民解放军总医院 |
| 5 | 天津医科大学总医院 |
| 6 | 首都医科大学宣武医院 |
| 并6 | 中南大学湘雅医院 |
| 8 | 第四军医大学西京医院 |
| 9 | 哈尔滨医科大学附属第一医院 |
| 10 | 山东大学齐鲁医院 |
| 消化病 | 医院 |
| 1 | 第四军医大学西京医院 |
| 2 | 北京协和医院 |
| 3 | 中国人民解放军总医院 |
| 4 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 |
| 5 | 第二军医大学长海医院 |
| 6 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 7 | 南方医科大学南方医院 |
| 8 | 首都医科大学附属北京友谊医院 |
| 9 | 中山大学附属第一医院 |
| 10 | 四川大学华西医院 |
| 小儿内科 | 医院 |
| 1 | 复旦大学附属儿科医院 |
| 2 | 首都医科大学附属北京儿童医院 |
| 3 | 浙江大学医学院附属儿童医院 |
| 4 | 重庆医科大学附属儿童医院 |
| 5 | 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 |
| 6 | 北京大学第一医院 |
| 7 | 四川大学华西第二医院 |
| 8 | 上海交通大学医学院附属新华医院 |
| 并8 | 首都儿科研究所 |
| 10 | 中国医科大学附属盛京医院 |
| 小儿外科 | 医院 |
| 1 | 首都医科大学附属北京儿童医院 |
| 2 | 复旦大学附属儿科医院 |
| 3 | 中国医科大学附属盛京医院 |
| 4 | 上海交通大学医学院附属新华医院 |
| 5 | 重庆医科大学附属儿童医院 |
| 6 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 7 | 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 |
| 8 | 广州市妇女儿童医疗中心 |
| 9 | 首都儿科研究所 |
| 10 | 浙江大学医学院附属儿童医院 |
| 心血管病 | 医院 |
| 1 | 中国医学科学院阜外心血管病医院 |
| 2 | 首都医科大学附属北京安贞医院 |
| 3 | 复旦大学附属中山医院 |
| 4 | 广东省人民医院 |
| 5 | 北京大学人民医院 |
| 6 | 北京大学第一医院 |
| 7 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 8 | 沈阳军区总医院 |
| 9 | 第四军医大学西京医院 |
| 10 | 四川大学华西医院 |
| 心外科 | 医院 |
| 1 | 中国医学科学院阜外心血管病医院 |
| 2 | 首都医科大学附属北京安贞医院 |
| 3 | 复旦大学附属中山医院 |
| 并3 | 广东省人民医院 |
| 5 | 第四军医大学西京医院 |
| 6 | 四川大学华西医院 |
| 7 | 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 |
| 8 | 中南大学湘雅二医院 |
| 9 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院 |
| 10 | 中国人民解放军总医院 |
| 胸外科 | 医院 |
| 1 | 中国医学科学院肿瘤医院 |
| 2 | 同济大学附属上海市肺科医院 |
| 3 | 上海市胸科医院 |
| 4 | 四川大学华西医院 |
| 5 | 北京大学人民医院 |
| 6 | 复旦大学附属中山医院 |
| 7 | 广州医学院第一附属医院 |
| 8 | 中山大学肿瘤防治中心 |
| 9 | 天津市胸科医院 |
| 10 | 第四军医大学唐都医院 |
| 血液学 | 医院 |
| 1 | 中国医学科学院血液学研究所 |
| 2 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
| 3 | 北京大学人民医院 |
| 4 | 苏州大学附属第一医院 |
| 5 | 浙江大学医学院附属第一医院 |
| 6 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院 |
| 7 | 北京协和医院 |
| 8 | 四川大学华西医院 |
| 9 | 中国人民解放军总医院 |
| 10 | 山东大学齐鲁医院 |
| 眼科 | 医院 |
| 1 | 中山大学中山眼科中心 |
| 2 | 首都医科大学附属北京同仁医院 |
| 3 | 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 |
| 4 | 天津市眼科医院 |
| 5 | 温州医学院附属眼视光医院 |
| 6 | 北京大学人民医院 |
| 7 | 北京协和医院 |
| 8 | 北京大学第三医院 |
| 9 | 浙江大学医学院附属第二医院 |
| 10 | 山东省眼科研究所 |
| 整形外科 | 医院 |
| 1 | 上海交通大学医学院附属第九人民医院 |
| 2 | 中国医学科学院整形外科医院 |
| 3 | 第四军医大学西京医院 |
| 4 | 第三军医大学西南医院 |
| 5 | 北京大学第三医院 |
| 6 | 南方医科大学南方医院 |
| 7 | 第二军医大学长海医院 |
| 8 | 北京协和医院 |
| 9 | 第二军医大学长征医院 |
| 10 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院 |
| 肿瘤 | 医院 |
| 1 | 中国医学科学院肿瘤医院 |
| 2 | 中山大学肿瘤防治中心 |
| 3 | 复旦大学附属肿瘤医院 |
| 4 | 天津医科大学附属肿瘤医院 |
| 5 | 北京大学肿瘤医院 |
| 6 | 山东省肿瘤医院 |
| 7 | 浙江省肿瘤医院 |
| 8 | 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院 |
| 9 | 四川大学华西医院 |
| 10 | 江苏省肿瘤医院 |
