该军前身是西北军第3路军韩复渠一部。1937年8月抗日战争全面爆发后，国民党军队在进行整编中，将西北军第3路军部扩编为第3集团军，原所属4个师及独立旅扩编为第12、第55、第56三军。其中，曹福林任第55军军长，下辖：
第29师，曹福林兼任师长；
第74 师，李汉章任师长。
该军组成后，奉命驻防鲁北惠民、齐东一带。
1937年9月下旬，日军侵占平津后，分路南犯。时任第3集团军总司令韩复渠擅自撤退，从德州、济南、泰安，一味向南撤退，以致日军长驱直入鲁南至徐州地区。此后，第3集团军总司令韩复渠由于率部擅自撤逃，被蒋介石下令枪毙，曹福林升任第3集团军总司令兼任军长。1937年底，该军隶属第1战区，参加了津浦路北段沿线的作战。1938年3月下旬，该军参加了台儿庄战役，赴藤县以北，参加了阻止日军增援台儿庄的作战。同年8月，该军编入第5战区第2线兵团，参加了武汉会战。武汉失守后，该军撤至湖北、河南的平汉线以西地区修养。1939年4月至1944年秋，该军隶属第5战区第33集团军，先后参加了随枣会战，1939年冬季攻势作战、枣宜会战，豫南会战、第2次长沙会战、鄂西会战、常德会战和豫中会战等。1944年秋，第12军第22师、第81师改隶该军。此时，该军下辖：
第22师，师长谭乃大；
第29师，师长荣光兴；
第74师，师长李益智；
第81师，师长葛开祥。
1945年，该军驻湖北均县时参加了豫西鄂北的会战。
1945年8月，抗日战争胜利后，国民党军队进行整编时，该军第22师被裁减，第81师改隶第68军，另将第69军第181师改隶第55军。此时该军隶属第4绥靖区，驻防在河南商丘地区。曹福林任军长，米文和任副军长。下辖：
第29师，荣光兴任师长；
第74师，李益智任师长；
第181师，张雨亭任师长。
1946年下半年，国民党军队进行整编，该军改编为整编第55师，原军长曹福林改任师长。原第29、第74、第181 师依次改称为整编第29、整编第74、整编第181旅。此次整编后，改整编师在冀鲁豫地区先后参加了陇海路中段战役、定陶战役、巨野战役、鄄城战役、巨金鱼战役、豫皖边战役等作战。在上述战役中，该师整编第29旅、第181旅被人民解放军歼灭后又重建。1947年3月起，国民党军队开始重点进攻山东和陕北战场时，该整编师隶属第4绥靖区，担任鲁西南地区战役中，该整编师的师部及所辖第29、第74旅被解放军全歼，师长曹福林逃脱，副师长理明亚被俘。
1948年9月，国民党军队进行整编时，该师恢复第55军番号。曹福林任军长，米文和、许文耀、陈宇书任副军长，白耀先任参谋长。原辖整编第29旅恢复第29师番号，黄俊芳任师长；原整编第74旅恢复第74师番号，李益智任师长；原整编第181旅恢复第 181师番号，米文和兼任师长。该军编制恢复后，由郑州后撤淮南地区，途中与发起淮海战役的人民解放军遭遇，第181师被歼，副军长兼师长米文和被俘。战后重建第181师。同年12月，该军由蚌埠南撤到淞沪地区，担任铜陵至九江长达400里的江防。1949年4月下旬，解放军发起渡江战役后，该军由青阳、石棣南撤，经浙赣路向福建撤退。5月中旬，该军进入福建漳龙地区。同年8月至11月，该军参加了福州战役和厦门战役。在厦门战役中，该军主力被歼，第74师师长李益智被俘，军长率残部乘船逃往台湾后，该军番号被撤消。
