解放后，林彪就称病不出，他亲自手书座右铭：张良范蠡，急流勇退。另一张条幅：天马行空，独往独来。他不与任何一位中央首长往来，包括毛泽东。
一九五七年卢山会议上打倒彭德怀，没有人敢唱反调，有人诬谄彭德怀在红军时期就想夺毛泽东权，林彪站出来澄清事实，替彭德怀承担。批判彭德怀，每个人要发言表态，林彪比众人讲话更“绝”：“在中国，不要想逞英雄，只有毛主席才是大英雄！”反话正说。
毛泽东酝酿发动“文革”之前，就考虑到林彪的立场要大规模的铲除政治异己，必须确保军队对他的效忠，必须掌握住林彪。
“文革”初期，毛泽东数次指令林彪进京，林彪不肯进京，从哈尔滨躲到大连。毛泽东调不动林彪，心中不快，吞食安眠药，声言“活得没意思”。周恩来窥悉毛的心思，以恩师身份出面做林彪工作。
据林彪身边人说，林彪根本不相信毛会自杀，他对叶群说：“不想活了，还那么左。”
十一中全会前，毛泽东开了个小型会议，到会者有毛泽东、周恩来、陶铸、陈伯达、康生。毛泽东要选一个接替刘少奇的人，五人按照毛的提议，各写一条，展示开来上面都写一个“林”，与会者都摸到了毛的心思。
一九六六年八月七日，林彪从大连到北京，空军司令吴法宪得报赶去机场迎接，本想讨个好，见林彪毫无喜气，脸色不好，吓得话也不敢讲赶紧溜了。(金秋自叙)林彪在北京没有住宅，毛泽东当时住在人民大会堂西大厅，叫林彪也住进去，毛、林住处之间仅一墙之隔。
据林彪身边人讲，林彪去见毛泽东，进门就向毛作揖，托称身体有病，不愿接任新职。毛泽东大怒，骂林彪：“你想当明世宗！”(明世宗即明朝嘉靖帝，虔信道教，不问政事)严斥林彪：“你不想介入运动是假的！”
运动已开始，社会上已闹得人仰马翻，许多家庭已趋家破人亡边缘，“批判走资派”、“破四旧立四新”正如火如荼。据知情人讲：“两边反差巨大，林彪这边愁云惨雾，唉声叹气；主席那边欢声笑语，莺歌燕舞。林彪对叶群说：‘看他以后怎么收场’。”
江青领导的“中央文革”小组已成了中国实际上的首脑机构，她乱了中央和各省政府，又染指军队，林彪嘱咐叶群：“不能让这个女人插手军队，军队不能乱。”
毛泽东从组织上规范了军队在运动中的位置，指示成立“军委文革小组”，江青出任顾问，穿上军装以后，又担任副组长之职，就像“中央文革”小组一样，她虽是副职，却起著中心主导作用。
为防止军队动乱，林彪指示秘书起草《军委命令》，实际上是针对江青的预防措施，保护军队出部。
毛泽东退回了原件，批示：“此令作废。军队要介入。军队不能成为防空洞、避风港。”
叶群对林彪说：“我说的吧，你还不相信，你的办法行不通。主席怎么说你就怎么办。走一步看一步，天塌下来有比你高的人顶著。”
违背林彪原意的《军委命令》经毛泽东审批改过以后下达，全军直属机关单位、院校、医院、文艺团体“踢开党委闹革命”，军内造反势力恶性膨胀肆意横虐，冲击军事首脑机关，破坏战备设施，残酷揪斗军区各级首长。北京发展到冲击各军兵种总部，甚至国防部，从将军到元帅都被当作靶子。
凡是反对江青及其“文革小组”的人，都被毛泽东点名打倒，诸如谭震林、陶铸等等。在一次接见造反派领袖的谈话中，毛突然不著边际的冒出一句：“那个贺龙，到哪都带著枪嘛。”仅此一句，军队最高的元帅阵营开了缺口，军内外造反派气焰更加嚣张，捏造出“带枪的刘邓”、“二月兵变”。毛泽东亲自下令逮捕贺龙，停职审查陈毅。周恩来在毛泽东的批件上写了数百字的批语，据看过批件的人透露，“总理把贺龙骂得狗血淋头，没说一句好话。在陈毅的批示上，也没有说好话”。不跟江青配合的朱德、陈云、刘伯承，都在内部做了检讨，从此闲置在家。
军队大乱，各军纷向军委告状求援。听秘书说，叶群做林彪工作：“这个‘火’，是主席点的，你要‘灭’，可要得罪人。几次请示人家不理你，我看你还是把这个球扔给总理吧。”
但是周恩来很快的把“球”踢还给林彪。
南京军区传来许世友盛怒之下可能会开枪杀人的急报，各军区已出现高级将领被斗死斗残的情况。据“林办”秘书讲，林彪看著堆积如山的告急文电，气得脸色发青，说“不能再置之不理”。叶群劝说：“军队开展运动是毛主席批示的，你签的字。要变动，也得先听听江青同志的意见，你不能先自决定，她后面那个人你是得罪不起，我看上面没表示，你就先摆一摆、放一放吧。”
这次林彪没有再理叶群，说：“我是军委副主席，我不管谁管？！”叶群悻然道：“上面还有军委主席(指毛)，外面情况他不会不听说，他不表态，你著什么忙。”
林彪召集叶帅、徐帅、聂帅共商对策，制定了九条，呈报毛泽东。之前先呈报江青，江青删除了两条，恰是制止军队动乱的根本措施，即恢复党委领导和禁止全国跨行业串联这两条。剩下七条。毛泽东对江青删除的两条不加置评，增补了一条对高干子女教育问题，七条变成八条，并批示：林彪同志所拟八条很好，照发，还对林彪幽默一句：“还我长城。”
新军委命令的后台是林彪。军队依照命令制止内部动乱，收到显著成效。军队的稳定影响了地方，全国局势一度趋势于稳定。
江青醒悟为时已晚，向毛泽东告状，说军队是运动的“死角”、“军内走资派反攻倒算”、“还乡团”等等，又通过渠道鼓励各地“受压制迫害”的军队造反派上京告状，“争取参加运动的权力”，并公开提出“揪出军内刘邓路线”、“捍卫毛主席革命路线”、“保卫文化大革命成果”等针对军队“反攻倒算势力”的口号。毛泽东对此不表态。新军委命令又一次成了一张废纸，军内造反派再次大规模的冲击军事机关，势如破竹，北京公开揪斗众元帅。
林立衡去见林彪，提出疑问，林彪沉默很久才回答自己的女儿：“政治问题不像打仗，能做出明快果断的决定。”据林彪身边人说“这一番较量，林彪又输了”。还说“哪个将军喜欢坐空营帐”。
国家功臣元老，不论地方或军队，打倒的打倒靠边的靠边，江青得意之余给叶群打电话，轻飘飘的竟在电话上唱小曲。叶群心中虽然不快，她的丈夫被架空，军委成了空架子，国防部长是光杆司令，但她不得不逢场做戏，陪著江青在电话上哼“小放牛”。据秘书说：“她哼哼叽叽的唱，心里哪会舒服。”
叶群这人，据了解她的人说，聪明得有点“鬼灵精怪”，林彪不问政时期的家居生活，家里家外事无巨细都交给叶群处理，林彪从不管，叶群件件事办得都能令林彪满意，林彪已习惯了依赖叶群。林彪到北京后，叶群处心积虑为林彪设计新形像，有些方面著实过份，群众自发的现象，她都加以归纳提高再推广，并叫林彪带头示范。在崇拜风靡的年代，很有市场。对毛泽东的态度也虚假得让人累得慌，据李处长讲上天安门的体验，为了表现林彪的“谦恭礼让”，把工作人员累得快倒下。每次上天安门，叶群总提醒林彪“一分钟”，意思是比毛泽东提前一分钟到达，太早到了怕毛泽东疑心林彪抢风头，晚到了更不行，怕毛泽东嫌林彪不恭，所以既早不得也晚不得，一分钟不早不晚恰到好处。这一分钟哪能掌握得好？李处长领著人分四种情况演习：夜里、白天、晚上；人多或人少；交通堵塞时或不堵塞时；车速快或慢；每一趟行车都分秒计算。每趟上天安门，毛家湾就像面临一场大阵仗，要打听出发时间，好掌握最佳的药力发挥时间给林彪服药，一听说毛泽东要出发了，这边就像救火似的搀扶林彪上车。林彪上天安门，就像老太婆的缠脚布，外表光鲜，里面乱七八糟，不但是林彪的负担，也是“林办”的负担。
在对待总主任萧华的问题上，林彪曾一再叮咛叶群：“萧华不能轻易点名打倒，这样大的事必须请示主席。”
因为江青紧盯萧华不放，拉住叶群迫林彪表态，林彪对叶群发脾气：“这个女人很讨厌！得寸进尺，坏点子太多，要小心。不要再让她见我。萧华历史上没有错误，红小鬼出身，对待他一定要慎重。”
萧华最终还是被江青打倒了，但是张春桥并未如愿登上总政治部主任宝座，林彪向毛泽东推荐十二军军长李德生，他在处理群众武斗方面有贡献，后来演化成军队“支左”。
在打倒杨成武事件上，林彪也做了抵制。提议杨成武当总长的人是林彪。毛泽东未表态，叶群说林彪：“你不先摸主席意思就提名，还是在前面加个‘代’字，报上去让主席确定。”林彪听从叶群意见，果然毛泽东批下杨成武当代总长。
江青首先发难要打倒杨成武是不争的事实。林彪限制叶群与江青接触，曾为此夫妻俩争吵过，叶群也要秘书们配合她胡瞒过林彪。叶群也劝过林彪：“江青倒杨的决心大，你挡著，她背后那人你得罪得起嘛！”
林彪发脾气：“你以后少去钓鱼台！总长一个接一个打倒，我这个国防部长还怎么当！任命是我签字，打倒他我怎么说！任命几天就打倒，那个婆还把我放眼里吗，不理她！”
叶群挨斥，对秘书吐苦水：“首长对老同志有感情。江青的后台我们惹不起。首长当中拦著不计厉害，真出什么错可怎么办。他整天坐家里不问外面事，我不能不替他操心啊。”
最终杨成武是被打倒了，叶群从中起了很坏的作用，某种程度上讲，她为了迎合江青，出卖了自己的丈夫。在驻京机关万人批判杨成武的大会上，林彪被骗到会场，事先江青说：“主席也去，总理也去。”等叶群劝说林彪到了会场，毛泽东临时取消赴会日程，在毫无准备情况下，林彪被周恩来劝上台讲话。据“林办”秘书们说，“林彪气得语无伦次，讲完话不跟总理打招呼就回了毛家湾”。林彪走后，周恩来上台讲话，并喊出“江青同志万岁”的口号。这个会实际上是江青预谋的打倒杨成武的会，并不是什么批判杨成武的会。因为林彪上台讲了话，打倒杨成武成了既定的事实。
杨成武倒台后，林彪不等江青开口，向毛泽东建议任命广州军区司令员黄永胜当代总参谋长，毛泽东问林彪：“这个人是不是老同志？”
林彪回答：“是一方面军的老同志。”
毛泽东说：“既然是老同志，就不要什么‘代’了，就让他当总参谋长吧。”
林彪在“文革”中的表现“鱼目混珠”，真假难辨，他有错也是事实。贺龙元帅受到迫害一案，我曾问过办案人员，“贺龙是不是林彪迫害的？”得到的回答是“贺龙一事与林彪无关”(指下令逮捕关押贺龙)。另据看过批件的人说林彪在贺龙案件上没有一句批示。可是许多“文革”中的大案要案，都扯上了林彪。连毛泽东也说“许多事我不知道，是林彪出的”。并且亲自下指示为很多冤案平反，许多老干部和遗眷感激涕零。但据接旨平反的官员说，打开档案，上面均有毛泽东亲笔批示。聪明的官员为避横祸上身，凡是上面交代平反的人与事，只照章办理，一律不看档案，全部封存。
毛泽东死后，公审“四人帮”，江青在法庭上大叫：“我是毛主席的一条狗！他叫我咬谁我就咬谁！”江青的可悲可恶的一句话泄尽天机。
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