民進黨臨時中執會四點決議包括：

一、維護民進黨清廉傳統，並依廉政條例規定，中執會無異議通過，本案中被起訴的黨員，移送中評會儘速處份。

二、檢察官起訴書中，並沒有敘明國務機要費有沒有流入私人口袋，而陳總統過去為了維護機密外交工作，無法辦外說明相關用途，因此，我們要求總統對起訴書列舉的疑點，詳細說明，以昭公信。

三、總統未編列首長特別費，而國務機要費有首長特別費的性質，但這點和檢察官的認定，有相當的落差，因此，民進黨將推動國務機要費相關法規的法制化。

四、清廉是民進黨的核心價值，對於國務機要費一案，引發社會騷動，本黨感到歉疚，並向社會致上最高歉意。