1989年国务院发布的《特别重大事故调查程序暂行规定》第十九条规定“特大事故调查组成员应当符合下列条件，包括具有事故调查所需要的某一方面的专长，以及与所发生事故没有直接利害关系。”据此规定，7.23事故应由国务院组成调查组，成员中可有铁道方面专家，但不能由铁道部主导调查。(目前，国务院已经成立独立的调查组调查该事故）
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中国众学者愤起 呼吁解散铁道部
温州动车追撞特大事故已引起大陆内地民意沸腾，虽然总理温家宝27日要求当局给人民群众一个真诚负责任的交代，但中国民间学者却纷纷发言，不但要求启动宪法第71条规定，即由全国人大常委会设立特别调查委员会，对事故进行调查听证，甚至有声音要求解散铁道部。
公开提出这一建议的北京大学法学院教授贺卫方指出，现在每逢发生重大突发事故，就由与事故有联系的部门或者其主管部门进行调查和发布结论，公众包括媒体基本没有办法去一线了解真相，这种模式非常不科学。他说：“让犯错的人去调查自己在哪里犯错了、犯的错有多大并承担纠错的责任，这是不符合人性的。”
1989年国务院发布的《特别重大事故调查程序暂行规定》第十九条规定“特大事故调查组成员应当符合下列条件，包括具有事故调查所需要的某一方面的专长，以及与所发生事故没有直接利害关系。”据此规定，7.23事故应由国务院组成调查组，成员中可有铁道方面专家，但不能由铁道部主导调查。(目前，国务院已经成立独立的调查组调查该事故）
贺卫方提出，可由铁道部主动促请全国人大紧急设立特委会，负责事故调查，“这是一种对公众负责任的做法”。
西北政法大学副教授谌洪果指出，此次事故发生后，除铁道部自查外，公众也借助网络尤其是微博等公共平台展开民间调查，但由于调查力量的不平等和体制性阻碍，难以避免谣言和猜测，因此不具备权威性，国务院虽将成立调查组，但自上而下的传统调查模式，无法从根本上解决制度问题，而司法部门的介入则局限于事件定性后的法律追究。
大陆另一著名政治学者、中国文化研究所研究员刘军宁，27日更在微博上倡议撤销铁道部，并随即获得多名学者和网民支持。刘宁军指出，铁道部是个腐败窝，只为政绩服务，不为民生服务。它是计划经济和全民军事化的产物，早应被淘汰。刘宁军以外国例子支持他的看法，他说，在国际上向中国提供先进铁路技术的国家，没一个设立铁道部。
不少网民都支持他的看法，有帖子指出，铁道部俨然是中国的国中之国，有自己的公安、检察、法院系统、有自己企业，但却无人监管；有网民说：“早在1998年实行大部制改革的时候，铁道部本来就和当时被撤的电力工业部、煤炭部等部门一样，在计划撤销之列，只是后来由于种种原因没撤成。随后几年，不断有铁道部可能被撤的消息传来，但未见落实，现时该重新提上议程了。”
其中提出建议的学者之一贺卫方，是中国司法改革的标志性人物，1995年起在北京大学执教。2009年3月贺卫方被北大派去新疆石河子大学“支教”，有评论指是因其敢言而被“流放”，贺卫方对此则表示，北大作出让其支教的决定，是需要对某些机构“有交代”，但他却将所谓的惩罚看做是“奖赏”。他还强调，并不担心自己会像刘晓波一样因言获罪或是遭封杀，相信政府会珍惜我，千人之诺诺，不如一士之谔谔。贺卫方，在中国变成了一道符号。在学界，他被视为司法改革坚定的鼓吹者；在实务界和舆论界，他被看作宪政、民主、法治思想的布道者；当然在另一些人眼中，他是一个“有些异端色彩”的多事者。
