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沏一杯茶,犒劳一下自己---手填税表做完了
昨天就搞完了联邦税,今天把州税填完,能拿回来总共1800,够交五月份就要来的房地产税账单的三分之一了。。。
LOL,穷人就是这么计划着每分钱的用途的。今天带领导去看open house,真不错的房子,就是太贵啊,房地产税就比我现在的多出差不多一倍。问领导:你是愿意多干三年住这个房子呢,还是早三年退休?领导毫不犹豫地选择后者。。。
不错不错,春天来了,今天带领导去湖边走了一英里。懒虫走不动,我只好自己多走了几圈,四英里吧。马上可以种菜了,先把体力提升点,翻地有力气才行。领导问要不要买一卡车top soil,我说等退休后再买,现在没时间一桶一桶从driveway搬到房子后面的菜园子呢。。。
(二0二0年二月二十三日)
昨晚回家,给领导交待了家底
我家领导是甩手掌柜,从来不知道家里的财政状况的。她的口头禅就是:你办事,我放心。。。
这不,冠状病毒当前,昨晚整理完税表,准备今天寄出去的时候,就把她叫过来,在她的记事本上,写好各个账户的大致情况,从life insurance找雇主的那个部门,到退休账户的密码,再到银行户头的双重保护密码。。。看完了,人家鼻子一歪:我们账户不少,钱倒不多么。。。
斜了她一眼:不是让你多干两年么。。。
(二0二0年二月二十六日)
科普--冠状病毒的核酸检测
所谓病毒核酸检测,就是检测病毒的遗传物质。冠状病毒是RNA病毒,就是检测病人样品里有没有冠状病毒的特异RNA,原理上和犯罪现场检测犯人的DNA差不多:就是通过上世纪八十年代末九十年代初发明的PCR技术。
前面的科普提到DNA/RNA是由四种不同的核苷酸的单体形成的聚合物。有了一条现成的聚合物(X),它对应的另一条(Y)可以通过核苷酸的配对原则(A:T/U或者G:C)来合成。也就是现成的一条作为模板(X),合成另一条(Y)。新合成的一条(Y)在下一轮也可以作为模板,反过来合成最先的X。。。这个循环反复进行,一变二,二变四,四变八。。。条件容许一个X分子,经过30个循环,就可以变成2^30条X,自然可以达到检测需要的量了。
上面这个循环就叫Polymerase Chain Reaction(PCR)。它需要一个起始的小片断,我们叫引物。引物一般是20个左右的核苷酸组成的聚合物,只要引物找到配对的模板,Polymerase就根据模板的序列,在引物上面不停地按配对原则加核苷酸,把一个20左右核苷酸长度的引物变得和模板一样长。所以,是引物的特异性(序列)决定了PCR能扩增那个特异的DNA/RNA模板。假如一个引物的序列是:5’AGGTCGGATGCTCCTTAGGAG,21个核苷酸,按照配对原则,它找到的模板一定很难得。这就是知道了冠状病毒的RNA序列之后,可以很快设计出冠状病毒特异引物的原理。一个引物只能延伸出一条DNA链,要两条链都扩增,PCR就用两个引物,来回扩增。。。所以,保证这个扩增出来的PCR产物一定是冠状病毒的,有两个引物的特异性把关,还有PCR产物的大小也是已知的。
PCR的模板只能用DNA,不能用RNA。所以,对RNA病毒,用PCR方式来检测,就是先提取样品里的RNA,然后进行一步叫“逆转录”的反应,也是按核苷酸配对原则,合成DNA后,再PCR检测DNA。。。
从中国发表冠状病毒全序列后,核酸检测就可以实施了,所以核酸检测是最先实施的。一个有经验的博士后或技术员,一个分子生物学实验室就可以做,或者每个州的forensic实验室也基本能胜任。这个方法的问题出在病毒是RNA上----RNA没有DNA稳定。我早期在国内做RNA,都很仔细的,主要是降解RNA的RNase无处不在,还特稳定,所以,那时候装试剂的玻璃瓶都是摄氏400高温烤四个小时才能用的。现代实验室都是一次性塑料制品,好了很多。但就是现在我们用商业kit提取RNA后,都是负70度保存的。所以,从病人身上取样后,保存不好;或取样量不够;或病毒RNA被降解等等,就会检测不到。这个也是早期中国用核酸检测武汉病毒碰到的问题,很多阳性病人检测不出来。
PCR检测的另一个问题是样品污染。这个往往发生在试验操作人员的不小心上。PCR扩增产物是指数级增长的,一般我们作PCR循环,到了35个还检测不到,我们就定型阴性。如果还往上增加循环次数,往往就会有产物出来了,这样的结果我们度算不可靠的。一个实验室天天作同一个PCR产物,往往很容易产生交叉污染,阴性样品也会显示产品。所以,一般实验室会非常小心,经常会postive/negative control同时进行,确保PCR反映成功(positive control);同时没有交叉污染(negativecontrol)。
RNA不稳定性决定了最好是拿到样品后马上处理检测。美国病人不多,也就没有紧迫感。武汉湖北可是太紧迫了。而核酸检测可以同时处理大量样品,几个小时就可以出结果。就是有一些不准确也值得啊。。。可以边做边调整边改进。
我们也常做细胞培养micoplasma污染的。用商业Kit的感觉是需要高污染才能检测到。很多时候我凭经验就知道很可能有污染了,但PCR的kit经常检测是没有污染。碰到这种情况我们往往人为地让细胞多长几天,不换medium,等micoplasma累积多了就能看出来。实验室无所谓。但针对这个疾病,应该是宁愿把阴性搞成阳性,然后再检测确认,也不能放过阳性的。所以,kit的设计思路上可以有很大的调整余地。另外,检测是有和无,是定性的,PCR现在可以定量或传统方式的半定性。如PCR方式的循环次数多少,就可以改变测试的灵敏度的。我没用过CDC的测试kit,就不能提具体建议了。
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前几天还有一个研究生找我请教,如何通过PCR,克隆一个人的基因。他们都知道我有magic,用计算机software设计好了,还找我改进。我看了一下他的思路,问明了他要克隆的人基因在细胞里表达量高低和基因的大小和结构,指出了他设计的PCR引物偏小,每个引物多加两三个核苷酸就好;然后让他在作逆转录时别用kit里提供的通用引物,而是改成他要的基因的specific引物。昨天给我看PCR结果,高兴坏了:都浪费了一百多块钱去买公司的产品,然后自己花了一个礼拜时间,最后发现根本就没有他要的基因。找公司,公司自己试了,最后承认是没有,产品下架。。。我这30分钟就解决了他的问题。。。我开玩笑说,20年前的老知识还是有用的。
(二0二0年二月二十七日)
领导?把我的生日忘了
昨晚都上床了,就听见电话铃响:“喝不喝一杯?” 电话那头是酒鬼。
“啊,这么晚了。。。听背景你在开车?” 我问。
“是。刚给学生上完讨论课,回家路上呢。”酒友说。
“我家领导忙着给她爹娘打电话呢。”
“哦,我以为她记得你生日呢。。。” 酒友玩笑着。
咱生日多,农历阳历农历推选的阳历,那个方便就过那个啦。。。所以,领导忘了往往有办法补救的。这不,今早一起来,领导就嚷嚷:生日今天过。我做馒头给你吃。。。
晚上叫上老酒友,两人分享了一瓶泸州老窖。
儿子大学第三年的financial aid package下来了
寒假的时候就抓住儿子赶紧把申请送进去,谁想FASFA送回来的confirm邮件,说的是2019-2020的数字。我们查了几遍,明明我们填的表格是2020-2021的。糊涂了,去儿子学校网站查,说申请收到,等FASFA的数据。。。只好给儿子说:3/31之前还能送一轮申请。万一FASFA搞错了,等你春假回来我们再填一次吧。。。
昨晚儿子短信把学校的结果转给我:两万奖学金,一万出头的grant,work-study 2200,还有就是loan 5000了。今天赶紧把学校的开销调出来,七万出头。。。算了算,除了loan,我还要掏35000呢。边喝咖啡边给领导汇报:到五月份我今年的工作合同结束,要完成的任务很重啊--儿子第三年的钱够了,可换房顶的钱,五月份要来的房地产税,还有夏天全家度假的钱还没着落呢。。。
给儿子短信:贷款是政府补贴的,虽然比上年多了很多,你四年下来的总数也就17000。如果象姐姐一样大学毕业就找到工作,应该不是问题。work-study的钱爹妈来cover,你挣多少就花多少。老爸老妈还是match你挣的钱,但必须放Roth IRA。。。
穷人家就是这么数着钱过日子的。。。
(二0二0年二月二十九日)
冠状病毒当前,国内的“支援”要来了
昨天接到国内北京朋友的微信,她儿子在这里上学,担心美国的冠状病毒扩散,要寄口罩来。怕儿子上课忙,校园人杂,要寄到我家。顺便给我们分一百个。。。呵呵,我家就没囤口罩,这下终于有了。。。
这个朋友其实以前不认识的。因儿子要来上学,邻居是我表妹,就介绍过来了。送儿子来的时候见过一面,再以后就是孩子有事找找我,过节我们有空就叫过来吃个饭。父母知道了,很客气,每次孩子回来都不忘带点礼品给我们。上次儿子的信用卡被盗用后,怕寄丢了麻烦,不敢邮寄,找我们帮忙。正好我有邻居在国内,回来路过北京,马上让他们联系上,带过来。寒假儿子回去后,还托儿子带茶叶给我邻居,我们也跟着沾光。
朋友也是慢慢处出来的。。。
(二0二0年三月一日)
敢跟管钱的领导顶嘴,胆子不小。
我们也有国内朋友要给这边上学的孩子寄口罩。正好,让他们寄给我们国内正急需的亲戚,我们给他们孩子寄。