拉美西斯二世之子麦尔涅普塔赫统治时(公元前1236-前1223),埃及已开始面临内外交困的局面。利比亚部落由西方侵入,“海上民族”从爱琴海和小亚一带席卷而来,外患不断。国内阶级斗争形势也随之紧张,奴隶逃亡,甚至公开举行起义,同奴隶主阶级进行主仆争。约公元前1200年,第十九王朝在人民起义的打击下告终。第二十王朝拉美西斯三世统治时期(公元前1198-前1166),底比斯建造坟墓的工匠因饥饿而罢工,他们进入图特摩斯三世和拉美西斯三世的神庙,把官吏和祭司包围起来,迫使统治者们不得不向罢工者发放粮食。在此过程中,阿蒙神庙僧侣集团的势力大大加强。他们控制了埃及全部土地的1/10,有42万余只大小牲畜,8.6万余奴隶以及其他财富。最高僧侣的职务变成世袭,不再属于法老,完全独立于王权之外。神庙设有与神庙有关的经济与行政机构,并拥有武器。拉美西斯十一世(公元前1113-前1085在位)时,底比斯的卡那克神庙最高祭司长霍里赫尔夺得政权,建立第二十一王朝。在北方,利比亚雇佣军首领控制了王权。这样,历时4个世纪之久的新王国终于崩溃了。