蛋白酶缺乏症
蛋白酶消化蛋白质。蛋白酶缺乏症会在血液中产生过碱性症状。这并不是因为蛋白酶本身是酸性的，而是酸度是通过蛋白质与蛋白酶作用后被分解而产生的。有些人会吃素可能不是选择，而是因为他们体内无法生成蛋白酶，因而不能消化蛋白质的结果。由于体内的酸度来源于蛋白质的消化，蛋白酶缺失的人可能因为体内碱性过量而经常处于焦虑状态。
血液中的钙需要与蛋白质结合才能够被正常的输送到需要的地方。没有足够的蛋白质结合钙奠定关节炎等缺钙性疾病的基础。为什么呢？当血液因为缺乏蛋白质不能携带钙，身体就会从骨骼中抽取所需的钙，以维持体内酸碱度的动态平衡。这种情况在人食用碳酸钙补充剂时加重，如TUMS或其它抗酸剂，因为这增加了血液的碱性。血液不能有效地传输离子钙，因为钙离子需要一定程度的酸度环境。
过度碱性的人体会产生钙代谢的问题，如骨关节炎，骨质疏松，痛风性关节炎痛风性关节炎，退行性椎间盘的问题，骨刺及相关病症如坐骨神经痛坐骨神经痛和韧带的问题。
因为消化蛋白质的46 ％被转化后的需求为葡萄糖，蛋白质消化不足导致低血糖低血糖（低血糖症也有其他原因，如甲状腺功能减退症甲状腺功能减退症和维生素缺乏症） 。症状包括情绪低落，情绪波动，烦躁易怒。
因为体内的水分总是与蛋白质在一起，血液中的蛋白不足也意味着血液中水的不足。水去哪里了？进入到蛋白质构成的身体组织中！这会导致组织肿胀（水肿浮肿） 。水是通过血液被泵送到身体周围的毛细管并进入组织中的。通过一个相反的过程，它依赖于血液中的蛋白质汲取水的功能，从组织中再吸收到毛细血管中。这两种机制需要保持平衡。
蛋白质消化不良导致有毒的结肠。这一类的人往往有降结肠（腹部右下象限）的问题。这包括阑尾炎，甚至更严重的问题，如粘液性结肠炎，甚至结肠癌。
另一种蛋白质消化不良最常见的结果是慢性耳部感染，尤其是儿童。这是一种蛋白酶，钙缺乏症。要从中耳中排除液体，则必须增加血液中蛋白酶的存在。蛋白酶可以将水抽出中耳，还有脚踝，手和脚，并把它重新抽入血液。
蛋白酶是通过分解细菌碎片，某些病毒，以及其分解循环免疫复合物的能力参与免疫系统工作的。蛋白酶有消化血液中多余的碎片的能力，是血液清洁剂。蛋白酶缺乏的人会产生免疫缺乏症，使得它们容易受到细菌，病毒和真菌感染。
蛋白酶缺乏的妇女易患经前期综合征。唯一不能忍受蛋白酶的的人是那些有胃溃疡，胃炎或裂孔疝患者。
