一、参看基督教历史，教会不止一次公开驳斥科学研究成果。十七世纪意大利天文学家伽俐略(Galileo Galilei)证实行星绕着太阳旋转，不料会触犯罗马教廷，结果被宗教法庭裁定为异端。伽俐略临终前八年光阴，都在软禁中度过。
教会逼迫科学家的事，不仅发生在十七世纪。一九二五年，美国田纳西州中学教员斯科普斯(John T.Scopes)因在学校讲授进化论而被州政府拘控，结果被判罚款一百元。斯科普斯后来上诉得直，可是上诉得直的理由，是上诉庭认为斯科普斯被判的罚款金额过高。
二、很多人以为随着科学研究发展，人类根本不用再相信神，也可以解答一切疑难，宗教因此成为明日黄花。又有人以为近代科学定理与圣经教导必然抵触，譬如说，近代科学“证明”神迹是没有可能发生的，因此圣经记载的神迹必属虚构。又有人说按照进化论的说法，创世纪第一章所记的事根本不可能发生。英国生物学家、不可知论者赫胥黎(T.H.Huxley)说：“人若接纳进化论的观点，就不可能再相信圣经。”
在本章我们要看科学与基督教信仰的关系，尤其要检视“近代科学定理”与基督教信仰有否抵触。
科学与基督教信仰并非不能兼容
追溯起来，近代科学的培植土壤，正是基督教世界观。基督教相信一神，换言之，万有背后存在一个统一的意志，因此自然法则万古不变，不因时地转移。如果宇宙各处分神而治，“自然法则”就没有定律可言，而变成了因时、因地、因神而异——要研究、归纳、推演，就不知从何说起了。
此外，基督教相信创造万有的神，是全知全智、按序按理行事的神。科学家必须先相信宇宙间存在定律，人的探求推断才有意义。十六世纪科学家致力探究自然定理，他们相信自己研究的一事一物，都从一位满有智能的神创造而来。“人类从事科学研究，因为相信自然界有定规；科学家相信自然界有定规，因为相信有一位设立定规的神。”
基督徒相信的神，是超然物外的神，因此人可以通过“大胆假设、小心实验”来探究自然定规。相反，如果物与神等同(正如一些宗教所言)，人还可以做实验吗？又如果物质本恶(正如一些宗教所言)，做实验就不仅没有意义，更属不智之极了！基督徒相信物质本善，却与神有别，从这信仰引申出来的创世观“为科学事业铺路，成为科技发展不可或缺的动原”。
基督教信仰是科学研究的沃土——这可说是科学家、史学家、哲学家的公论。牛津大学(Oxford University)核物理学讲师贺治森(Peter Hodgson)说：“基督教信仰提供土壤，让科学思想发芽成长，也为科学研究发展提供养料。”史学家巴特非(Herbert Butterfield)认为“基督教思想乃科学之母”。哲学家麦慕理(John MacMurray)说：“科学乃昔日一场轰烈宗教运动之嫡子，其家谱可追溯至耶稣。”
有大量史实表明，基督教信仰与科学研究是世交多于世仇。
科学革命之父、天文学家哥白尼(Nicolaus Copernicus)是“日心说”的倡议人，同时是波兰费琅堡(Frauenburg)大教堂的教士，他说神是“宇宙间最卓越、最有条理的匠人”。
数学家、天体物理学家伽俐略，也是现代机械工程与实验物理学之父，他曾独排众议，不惜得罪罗马教庭，公开指斥“地心说”之荒谬。他虽然遭受教会逼迫，却至死保留天主教徒的身份。他曾经说：“天地间有两部巨著：自然之书、超自然之书——圣经。”
现代光学之父开普勒(Johannes Kepler)，也是出色的天文学家与数学家，他最为人知的贡献，称为“开普勒行星运动三大定律”。开普勒是个敬虔爱主的路德宗会友，他说自己“常以神的心为心”。
论到科学界的泰山北斗，史家可能会一致推许牛顿(Isaac Newton)。他的“牛顿力学三大定理”固然警世，在光学、天文学、数学也是贡献良多(人所共知的有微积分、光谱分析等等)。很少人知道的是：牛顿看重圣经权威，深信圣经是神的启示。牛顿除了撰写科学著作，也撰写神学著作，且觉得自己的神学著作比自己的科学著作更有价值。他相信世上没有任何学科比圣经神学更有理据、更具权威。
今日二十英镑钞票的肖像人物是十九世纪的科学翘楚法拉弟(Michael Faraday)。他发现电磁感应现象，从而研制出世上第一具电动马达和第一具发电机，可是法拉弟认为影响他一生最深的，是自己对基督的信仰。
很多一代科学宗师都是基督徒，包括发现“玻意耳定律”的玻意耳(Robert Boyle)；首创用消毒液进行外科手术消毒的利斯特(Joseph Lister)；发明“巴氏消毒法”的巴斯德(Louis Pasteur)；为遗传学奠定基础的孟德尔(Gregor Mendel)；现代物理学宗师开尔文(William Kelvin)；电磁场理论大师麦克斯韦(James Maxwell)等等。
有人问无痛外科手术的先锋辛普森(James Simpson)：“你一生中最重要的发现是什么？”辛普森答道：“是耶稣基督”。
时至今日，仍有很多科学家是基督徒。英国基督徒科学家同盟(Christians in Science)有会员七百多人，而美国的同类组织有会员七千多人。当代物理学大师、英国皇家学会(Royal Society)院士、剑桥大学(Cambridge University)女皇学院院长波京汉(John Polkinghorne)说过：
科学家可以向基督徒阐述有结构的实相，并宇宙悠长进化的过程，从而约束基督徒的口，叫他们不致在神创造世界的事妄下判论。神显然是极有耐性的神，愿意按部就班行事，而不喜欢任意介入自然定律。不过科学家也可以从基督教信仰得着启迪，开拓科学知识以外的眼界。自然界精致巧妙(反映神的心思)、生生不息(彰显神的意旨)，处处表明一件事实：万有由神创造。
科学与圣经并无抵触
科学家之间的争议与辩论，其实可能比科学家与神学家之间的争论更多更激，偏偏世人只觉得科学与神学势不两立。
很多人以为科学与神学必然矛盾，并以神迹为例。十七世纪理性主义先锋、犹太裔哲学家斯宾诺沙(Baruch Spinoza)宣称：世上万事都不能干犯自然通则，换言之，斯宾诺沙相信大自然是一个封闭系统。另一位哲学家休谟(David Hume)说神迹违反自然定律，因此不可能发生——但其实这说法属于“循环论证”：如果人已经把“自然定律”界定为“恒久不变的规则”。那么，就算一件神迹的证据如何确凿，既违反了“自然定律”，当然不可能发生。
一九三七年，物理学大师普朗克(Max Planck)宣告：“在科学知识稳步万进之下，神迹信仰只得节节败退，全面崩溃已是指日可待了。”普朗克的意思，是今日的科学已足以揭开昔日神迹的神秘面纱，古人相信神迹，不过是科学知识不足，不明白自然定律罢了。
事实并非如此。在耶稣的时代，人人都知道什么是自然的事、什么是超自然的事，譬如说，童贞女生子、死人复活，都不是“自然”的事！如果古人对自然定律一无所知，就根本不会有“神迹”的概念。鲁益师(C.S.Lewis)说：“神迹的存在，决不是建基于人对自然定律的无知之上——恰恰相反，是建基于人对自然定律(或多或少)的认识之上。”
最重要的问题是：“世上有神吗？”如果世上有神，神迹当然可以发生！神既有能力创造物质、理性、时间、空间、科学定律，当然有能力、也有自由介入世间事理。如果世上没有神，神迹的发生就欠缺理据了。
单凭哲学、科学、实在不足以解答世间一切疑难。科学定理不像纯数学定理——科学定理绝非牢不可破，却不过是描述性的陈述。斯托德(John Stott)说：“我不是说单凭神迹就可以确立有神论的根基，我只是说：如果我们真的信神，......就有理由相信(也实在没有理由不相信)神迹的实在，因为‘自然定律’不过在描述神行了什么事，却不能约束神会怎样行事。”
很多人认为科学与神学存在矛盾的另一例子，关乎进化论与圣经创世纪的记述——当中真有矛盾吗？
我们首要注意的是：进化论的大部分内容，仍不过是一堆未经证实的假设。而所谓“进化”，其实是相当笼统的说法，要了解进化论，起码要懂得分别两种性质不同的“进化”：第一种是“微进化”(micro-evolution)、第二种是“广进化”(macro-evolution)。“微进化”是指某物种的变异与发展，譬如说，我们今日所见的马，比起古代的马体形增加了、体能也提高了，这样的“进化”有凭有据，与圣经的记述也谈不上有什么抵触。
“广进化”是指某物种“进化”成另一物种，最著名的例子，是猿进化为人——很多人以为“人从猿进化而来”是科学界的公论，事实是：广进化论不过是未经证实的假设，更不是所有科学家的共识。其实一切科学定理都非绝对，以牛顿力学定理为例，几百年来，科学界牛顿力学定理为牢不可破的定理，后来爱因斯坦(Albert Einstein)等一班科学家证实了牛顿力学定理在一些情况下并不适用，才出现了量子力学、相对论等等“新定理”。今日有些学校在课堂上讲授未经证实的进化论，却把那些理论说成是“近代科学定理”，实在有违科学精神。
另一点要注意的是：一众基督教神学家，至今仍就创世纪的记述作出种种诠释。有人按字面解释六日创造——“六日”就是六天的时间。一九六三年，十位科学家在美国密芝根州成立创世研究学会(The Creation Research Society)，今天这学会的成员数以百计(会章规定会员必须持有自然科学或应用科学硕士或博士学位)，他们声称神在起初六日已创造了现今世上的一切生物，任何“生物异变”都不偏离神的起初创造。
另一些基督徒对创世纪第一章却有别的观点。他们指出“日”原文(希伯来文)可以有其它意思，而这个字即使在旧约中也有好些不同的用法。况且按照创世纪描述，太阳在第四日才出现，因此“日”可能不是指“一日(二十四小时)”，而是“一段时期(可以很久)”。换言之，创世纪的记述未必与现存的科学见解相悖。宇宙的“年龄”可能真的以亿年计，而世界被造之后，也可能真的发生过某种形式的渐变。再者，创世纪作者虽然没有近代科学知识，但他描述物种出现的顺序(植物、动物、人)，与进化论有相合之处。
也有人认为创世纪所记的不过是神宣告的刹那光景(“神说......”)，所宣告的内容却要好长一段时期才完全实现出来——这岂不跟“大爆炸理论”(“Big Bang theory”)相通吗？(大爆炸理论相信宇宙诞生的关键时刻不过为时几分钟。)
不少基督徒相信创世纪的陈述属于文学体裁，换言之，作者不一定按足神创世的具体顺序而写。创世纪不是科学论文，书成于久远的年代(远远在科学时代之前)，而作者关注的，又是科学范畴以外的课题。我们知道但凡文学体裁，绝不可纯然按字面作出解释，譬如诗人说：“......世界坚定，不得动摇。”(诗 93:1)诗人描述的是意象而不是现实——可惜伽俐略的对头、当时的宗教领袖偏偏要按字面解释圣经，才会坚称地球是宇宙的中心，因此怒斥“日心说”为异端邪说。
今日有些基督徒从历史得着借鉴，避免硬生生按字面解释创世纪头几章，他们有些人更声称“广进化论”证据充足，譬如说，从化石的年份显示，若要按字面解释创世纪头几章，的确难而又难。他们认为创世纪最重要的启示是：神创造宇宙万有，并以大能确保自然定律运行无误，因此生物得以进化，至终演变成人类。
无论如何，科学发现与圣经记载未必抵触。话又说回来，基督徒在很多关乎创世的问题上仍未有识，所以我们实在不宜太武断(尤其我们这些不是科学家或神学家的人，更不宜妄下定论)。
创世纪第一章的要旨不在解答“怎样”、“何时”(科学问题)，而在解答“为什么”、“谁”(神学问题)。圣经作者不在解答科学问题，而在解答神学问题。不过科学家与神学家所问的问题虽然本质有异，却能互补参照。一代科学宗师霍金(Stephen Hawking)说：“就算科学可以清楚描述宇宙起源的细节，仍不能回答一个问题：宇宙为什么存在？”
兰约翰(John Lennox)说了一个很好的譬喻：“假设我捧来一个美得不能再美的蛋糕，在我面前，是好几位来自世界各地、出类拔萃的专家与学者，他们要替我分析我的蛋糕。第一位站出来的是营养学家，他侃侃谈论蛋糕上各样材料的营养价值如何均衡有度；然后一位生化学家站出来讲解蛋糕的生化成份；另一位化学家站出来说：‘嗯，成份固然重要，但基本化学成份更重要。’；然后一位物理学家站出来说：‘他们的话都有道理，但我们必须先了解电子、质子、夸克(quark)等等的运行。’最后站出来的是一位数学家，他说：‘归根到底，你们必须知道那些电子、质子、夸克运行的数学方程式。’所有科学家天花乱坠一番后，我说：‘各位朋友，我只有一个问题要问：烘制这个蛋糕所为何事？’最后站出来的是烘制蛋糕的厨师，我亲爱的玛花达阿姨。
“只有烘制蛋糕的人，才会知道烘制那蛋糕所为何事。其它人的科学分析不论如何详尽透彻，也不能解答‘为什么’的疑问。”
“玛花达阿姨终于开腔说：‘让我揭开谜底吧！这个蛋糕是烘制给我姨甥的，他明天生日呢！’这就是答案！不论世上的科学家怎样努力探究，也不会知道这世界为什么要存在，除非世界的创造主向人显明他的旨意。可喜的是，创造主的确向世人显明了他的旨意——就记载在创世纪之中。”
