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冠状病毒病-19（COVID-19）大流行继续影响世界各地，然而医学科学因此也在不断提高，对SARS-CoV-2（引起COVID-19的冠状病毒）的诊断检测也是不断更新，所谓时势造英雄，就在昨天FDA又批准了一项新的测试，是圣地亚哥Quidel公司的基于病毒抗原检测。所以，目前对SARS-CoV-2的检测大概分为三大种：
一）抗原检测
五月八号，美国FDA批准紧急授权(EUA)给南加州圣地亚哥公司（Quidel）的Covid-19快速抗原诊断检测， 这是全球首个Covid-19病毒抗原检测方法。商品名称是Sofia 2 SARS 抗原荧光免疫检测分析仪( Sofia® 2 SARS Antigen FIA, a rapid point-of-care test to be used with the Sofia 2 Fluorescent Immunoassay Analyzer)。
以前一般（下面介绍）用PCR方法检测病毒核酸（RNA）。这个新方法测病毒表面的蛋白抗原。所以比核酸检测快且便宜。公司准备每周生产可测几百万例的试剂规模。
同样需釆集鼻腔，或鼻咽拭子样本来测抗原。几分钟内出结果。敏感度约85%，所以假阴性可以达15%，但特异性高，快速，便宜，方便，可用于医院，诊所，甚至工作单位或学校。
二）核酸检测（通过RT-PCR检测病毒RNA）
迄今为止，诊断COVID-19的最常用，最可靠的测试是使用鼻咽拭子或其他上呼吸道标本（包括咽喉拭子或唾液）进行的RT-PCR测试。不同的制造商使用的是各种各样的RNA基因靶标，大多数测试针对的是1个或多个包膜（env），核衣壳（N），刺突（S），RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）和ORF1基因。根据比较研究，这几种测试对单个基因的敏感性是差不多，只是RdRp-SARSr（Charité）引物探针的灵敏度稍低，这可能是由于反向引物不匹配所致。
在大多数有症状COVID-19感染的个体中，通过周期阈值（cycle threshold ，Ct）测量的鼻咽拭子中的病毒RNA最早在症状的第1天就可以检测到，并且在症状发作的第一周达到高峰。Ct是产生荧光信号所需的复制周期数，较低的Ct值代表较高的病毒RNA载量。临床报道Ct值小于40为PCR阳性。这种阳性在第3周开始下降，随后变得检测不到。但是，重症住院患者的Ct值低于轻度患者的Ct值，PCR阳性可能会在发病后持续3周，而大多数轻度病例会3周内变为阴性。但是，“阳性” PCR结果仅反映病毒RNA的检测阳性，并不一定表示存在活病毒。
在某些情况下，即使在首次阳性测试第6周之后，还可以用RT-PCR检测到病毒RNA。间隔24小时连续进行2次阴性PCR试验后，也有几例报告为阳性。目前尚不清楚这是测试错误，重新感染还是病毒重新激活。
在一项针对9名患者的研究中，从疾病发作的第8天开始就无法再成功分离培养物中的病毒，这与第一周之后的感染力下降相关。
这是为什么CDC“以症状为基础“的策略的部分原因。美国疾病控制与预防中心（CDC）指出，医护人员可以重返工作康复定义为：
1）退烧后至少三天（72小时）在没有使用退烧药情况下仍无发烧，
2）呼吸道症状（例如咳嗽，呼吸急促）改善至少三天；
3）自症状首次出现以来至少已经超过了10天。满足后则医护人员可以重返工作岗位。
除鼻咽拭子外，其他不同的样本的PCR阳性时间线也不同。鼻咽拭子阴性后，痰液中PCR阳性率下降较慢，可能仍为阳性。在一项研究中，在96名受感染患者中，有55名（57％）观察到粪便中PCR阳性，并且在鼻咽拭子以外的粪便中保持阳性4至11天，但与临床严重程度无关。Wölfel等认为痰和粪便中PCR的持续时间相似。
在205例确诊COVID-19感染的患者中，支气管肺泡灌洗标本中RT-PCR阳性率最高（93％），其次是痰液（72％），鼻拭子（63％）和咽拭子（32％）最低 。假阴性结果主要是由于与疾病发作有关的采样时间不适当和采样技术的不足，尤其是鼻咽拭子。大多数RT-PCR测试的特异性为100％，因为引物设计对SARS-CoV-2的基因组序列具有特异性。由于技术错误和试剂污染，有时也可能会出现假阳性结果。
三）抗体检测（SARS-CoV-2抗体的检测）
这是通过测量宿主对SARS-CoV-2感染的免疫反应（产生抗体）间接检测COVID-19感染。血清学诊断对于轻度至中度疾病的患者尤其重要，抗体可能会在发病后两周后可测出。血清学诊断也正在成为了解社区中COVID-19感染的程度， 并能那些人是具有免疫力的个体（可能“受到保护”免于感染的个体）。
最敏感，最早的血清学标记物是总抗体，其水平从症状发作的第二周开始增加。尽管IgM和IgG ELISA甚至在症状发作后的第四天就可能是阳性的，但更高的水平发生在疾病的第二和第三周。
根据对23例患者的检测，在临床疾病发作的第三周和第四周之间，所有患者均发生IgM和IgG血清转化，此后IgM开始下降并每周降低至更低水平，在第5周时几乎消失，而在第7周时IgM就完全消失了， 但IgG第7周后能能测出。在对140位患者的研究中，针对核衣壳（NC）抗原的PCR和IgM ELISA组合敏感性为98.6％，而单次PCR测试为51.9％。在发病的第5.5天后，定量PCR的阳性率比IgM高，而IgM ELISA的阳性率更高。
基于ELISA的IgM和IgG抗体测试对COVID-19的诊断具有95％以上的特异性。使用初始PCR和第二个2周后测试配对的血清样品可以进一步提高诊断准确性。通常，大多数抗体是针对病毒最丰富的蛋白质（即nucleocapsid ，NC）产生的。因此，检测NC抗体的测试将是最敏感的。
但是，S（RBD-S）蛋白的受体结合结构域是宿主附着蛋白，并且针对RBD-S的抗体将更具特异性，并且有望被成为中和抗体。因此，使用一种或两种抗原检测IgG和IgM会导致高灵敏度。然而，抗体可能与SARS-CoV以及其他冠状病毒具有交叉反应性。
用于检测抗体的快速即时检测已被广泛的开发和销售，并且质量变异很大。许多制造商没有告诉所用抗原的性质。这些测试本质上是纯定性的，只能表明是否存在SARS-CoV-2抗体。中和抗体的存在只能通过噬斑减少中和测试（plaque reduction neutralization test.）来确认。但是，已有证据显示通过ELISA检测到的高滴度的IgG抗体与中和抗体呈正相关。由中和抗体赋予的长期持久性和保护期限仍然未知。
W?lfel R? , Corman VM? , Guggemos W? , et al. Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019. ? Nature. 2020. Published online April 1, 2020. doi:10.1038/s41586-020-2196-xPubMedGoogle Scholar
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