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中坛网友八卦时,小颜团队在贡献

(2019-11-21 03:03:01) 下一个

中坛的网友喜欢八卦,聊天,无可厚非。毕竟人有社会需求,交友聊天解闷是人之常情。 今年聊天八卦的主题之一是颜宁。 不但对各种日常话题如婚姻,颜值,师承,任职等各个方面无所不聊, 还插手到人家的专业, 谆谆教导,显得无比关心,但还是不愿承认,来几个who cares?。  更对小颜提出了更上一层楼的要求, 要求她对网友有问必答。 特别是某博士问了个生化专业本科生级别,其他专业GRE阅读理解级别的问题,在自己没做功课的前提下问了过去,人家耐着性子回答了, 自己还不认可,不求是研读,耐心思考, 反而先入为主,继续追问, 被呛了一句,于是在坛子里掀起了轩然大波 。 更有好事者去骚扰人家院校,拷问跳槽的事。 人家小颜没把自己当回事,默默做研究, 同时帮其他院校培养人才,是好事者自己总自甘狗仔队,不看别人的研究,自己站在道德制高点上,专八卦人家的长短。 小颜科普与群众见面也成了诟病。 

中坛网友自己把时间花在这些八卦, 并对小颜恨铁不成钢的期间,小颜及其团队默默地在做着自己的贡献,在2019年的迄今11个月以内,至少发表了6篇论文(文献1), 其中5篇CNS正刊,另一篇是Nature的子刊 (文献2)。今天就从这篇不起眼的Nature子刊聊起。

一 葡萄糖转运蛋白结构对癌症研究与治疗的贡献。

癌细胞由于需要快速生长而偏好不需要氧气的糖酵解,而不是一般细胞的有氧循环(瓦氏效应),于是需要大量摄取葡萄糖,也就需要大量表达GLUT1和GLUT3--小颜研究的核心之一。 那么抑制癌细胞的 GLUT1和GLUT3就可能成为杀死癌细胞的手段之一。

颜宁团队从2012到2018做了蛋白结构的准备工作,2019发表了这篇根据蛋白结构,改造了细菌糖转运蛋白XylE,将其固定在面向细胞外,或者细胞内的构象,证实了XylE两种构象的葡萄糖结合位点不对称的亲和性。由于XylE与GLUT的相似性,加上前人的研究,他们推测人体糖蛋白也有着一特征。 利用这一特征,他们会继续研究如何分别筛选两种构象下的抑制物, 也就是潜在的药物。 通过结构筛选药物, 这是在癌症研究领域非常有意义的事。  

二 小颜是否投机取巧

某位博士生(以下简称博士生)曾经对颜宁工作做过整体评价(文献3),这个评价也经常被奉为圣典,来证明颜宁投机取巧。 怎么投机取巧法? 该博士认为,因为只要是搞晶体结构的文章就可发CNS, 颜宁团队就是剥削中国廉价的博士劳动力,一个蛋白换一个蛋白地结晶,反正改改条件结晶出来就是CNS. 还说实验条件就是不停试出来的。

1。人体葡萄糖蛋白结构,机理与应用一直是颜宁的研究方向之一。

博士生的檄文暗示小颜为了发CNS盲目地换蛋白.  实际上小颜从2012到2019至少发了7篇这个方向的论文。换蛋白也是从细菌换到人体,并解析了人体多种糖转运蛋白,几种构象的结构。 更重要的是, 这些转换并不是盲目为发文章而换的。 他们对蛋白及构象的选择很有针对性,策略性与方向感。并做了开创工作以后,把稍微简单点的细枝末节留给其他实验室,自己继续做开创性的工作。 这其实就是科学大家应该做的事。 

2。小颜团队啥实验都做。 

博士生用自己道听途说的“所知”谴责颜宁的学生只要卖苦力,结晶, 不用读论文。 我不知道这位博士生到底有没有读颜的论文,如果他读了颜2014一文(文献4),就该知道颜团队能成功结晶人体糖蛋白不是傻试出来的,而是通过查文献,Critical Thinking发现的新途径。 

并且小颜的文章篇篇有生化实验,这篇有关癌症的文章更是设计生物物理实验来达成实验目的。 有行外人说冷冻电镜是超越晶体的未来,说庄小威是未来。先不说晶体与冷冻电镜在目前来讲各有所长 (文献5), 实际上颜宁自己正在应用冷冻电镜 (文献1)。

实际上,做科研,特别是“大家”做科研,虽然用自己擅长的手段容易出成果,但是如果囿于实验手段就限制了自己。 对“大家”来说,最重要的是研究的方向是什么, 解决什么问题。 针对要解决的问题,寻求合适的实验方法, 该用晶体用晶体,该用冷冻电镜用冷冻电镜,而不是本末倒置地用手段定研究方向。 从博士生的对一点的的井底之蛙的评论,他的境界远远达不到做PI的程度。博士生还请自己提高境界吧。

至于小颜不重视培养下一代人才之类的话,生物界本来就是僧多粥少,一将功成万骨枯。而小颜的团队中的杰出代表Deng D.的成功 也否定了这一结论,请看他与颜宁合作的综述文章(文献6)。 

三 为科学家正名。 

从颜阎之争到地球暖化,吃瓜群众中总流传着对科学家的不信任。这不但包括中坛以及其他文学城网友,还有很多美国大众。 主要的推动力是美国烟草,糖业,石化产业长期用烟草商策略攻击诽谤科学与科学家 (文献7) 。 在此特别要为科学家正名。 

科学是个吃力不讨好的职业。 坚持在这一行干的,很少是为了钱的。虽然行行出状元,行行也出小人, 科学这一职业也不例外,总有那么几个坏典型。 但是如果从事科学的人,想赚钱养家享受,转行是相对容易的事。 留下来的都是对科学无比热爱并严肃认真的人。 作为群体,他们是道德标准要求较高,人品也较高的人群。 我虽然离开了科研,但是对坚持到底人无比敬佩。 这也是我为什么见到在没有事实依据, 或者依据不足的条件下褒贬科学家必须捍卫事实与科学家的原因之一。

科学论文有严格的审查程序。 科学家都有高傲的骨感,审稿可以说是个互相挑刺的过程。一篇文章从实验设计,完成,初稿,完稿几经删改,到最后发表是非常不容易的,聚集着众多科学家的常年的心血。 请不要再在没有根据的情况下,褒贬科学家。也不要没有必要地去骚扰, 让他们安心研究。 请多关注他们的研究成果,多给他们支持!     

四 文献。

1。颜宁实验室甄选文章:https://molbio.princeton.edu/people/nieng-yan

2。Jiang X, Wu J, Ke M, Zhang S, Yuan Y, Lin JYe, et al. Engineered XylE as a tool for mechanistic investigation and ligand discovery of the glucose transporters GLUTs. Cell Discov. 2019 ;5:14. 

3。https://argparse.github.io/2018/01/04/%E5%85%B3%E4%BA%8E%E6%96%BD%E4%B8%80%E5%85%AC-%E9%A2%9C%E5%AE%81%E7%9A%84%E7%A0%94%E7%A9%B6/

4。Deng D, Xu C, Sun P, Wu J, Yan C, Hu M, et alCrystal structure of the human glucose transporter GLUT1. Nature. 2014 ;510(7503):121-5. 

5. Shoemaker SC1, Ando N1.  2018 Jan 23;57(3):277-285. X-rays in the Cryo-Electron Microscopy Era: Structural Biology's Dynamic Future.

6。Deng D, Yan NCrystallization and Structural Determination of the Human Glucose Transporters GLUT1 and GLUT3. Methods Mol Biol. 2018 ;1713:15-29.

7。Oreskes, Merchants of Doubt

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Stegy223 回复 悄悄话 好文!

特别值得一提的是 Cell Discov. 2019
"改造了细菌(木)糖转运蛋白XylE,将其固定在面向细胞外,或者细胞内的构象,证实了XylE两种构象的葡萄糖结合位点不对称的亲和性”。有趣和精湛的工作! 让人想起了老阎关于小颜在细菌木糖转运蛋白XylE 和人葡萄糖转运蛋白GluT上搞 “鸡鸭大拼图”的指控。

SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 'valore' 的评论 :

用不完美否定实际哈。 那请你拿出比发论文更过硬,合适的指标。 没有的话,就只好依据科学界的现有标准了了。

或者你能具体用论据指出小颜论文哪点质量不够高吗?

valore 回复 悄悄话 CNS不是神。里面有问题的文章,没大用的文章多了去了。还有专门文章分析chaperone effect in scientific publishing. 天下文章千千万,哪有那么多ground breaking work. 在和平年代又竞争激烈的环境下,很多稿件对于期刊都是属于可上可不上的。这时圈子,关系便起到很大作用。明星们当然都是成功人士,人生赢家。不过,这与真正的好工作并不一定正相关。另外,虽然引用率也不是万能,工作的引用率也算个参考指标吧。
SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 'pconline' 的评论 :

抄袭这事早已从技术到引用常规各个方面都论证过没有这事了。 早该歇息了
SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 'valore' 的评论 : o

科学家贡献的主要指标就是发文章。 大期刊不是你为了买8名利想发就发的。 没有水平,没有贡献怎么发?
pconline 回复 悄悄话 抄袭润涛阎的成果怎么算?颜宁不是傍上施一公她能有今天?学术圈里像她那样资质的一大把,靠取巧算计+脸皮厚出名有什么好嘚瑟?天天show off,和网红一个德行
valore 回复 悄悄话 现在的科学家都快成贬义词了。有争议的人分为两类。第一类成名的,发大期刊的,反映的是名利的欲望,靠着运作手段一路往上爬。这种人应该叫明星。研究除了发文章,对科学前进并无实质性贡献。更糟糕的是造假,不能重复类的,那就是有academic integrity问题了。第二类,研究还是有用的,贡献有,但本人人文素养比较弱。拿无聊当有趣的已经不算大事。当然术业有专攻,人品完全是另一回事。能两角俱全的,实属凤毛麟角。
SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 '北美_原乡人' 的评论 :

说的是正道
北美_原乡人 回复 悄悄话 文章说得对。我纳闷的是城中有个把的教授专家学者怎么天天有那么多的时间去琢磨人家的东西,并偏好去扒人家的粪。过去在大学读书和研究的10年中,从未听说美国教授学者之间互相扒粪的事情。正确的科学研究和学术文化的风气和规范应该是:你不服气或者怀疑人家的成果,你就应该有本事做出更多的成果来超过人家。这个道理很简单:扒别人的粪一点不会让你的科研搞的更有成果,当然也不会让你更有名气。
SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 'Fanreninus' 的评论 :

我一直在坛子里告诉他们, 搞清事实再评论
SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 'BeijingGirl1' 的评论 :

谢谢!
BeijingGirl1 回复 悄悄话 回复 'Fanreninus' 的评论 : 我到那贴发言了。 虽然我不知到吵架的具体细节。 但我相信你。 哈哈。 有时候需要开口。 不然就像武汉那辆公共汽车, 都不出声, 全车人掉进江里。

谢谢你的信息。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 'BeijingGirl1' 的评论 : 看了你说的那篇文章,不知所云,连她兼职的学校的名字都写错了,应该是UNSW,再说人家那上面是学校管版简介,清清楚楚地写着那是一个荣誉职位。自己没有搞清状况,还说人家是脚踏几只船。
BeijingGirl1 回复 悄悄话 好文章! 好像看到一文的标题说要爱羽毛的,说的是颜宁。 一个人要出来做事, 特别是有点“成就”之后,总是会被个别人指指点点。 因为人无全人, 也因为有个别心理阴暗的小人。 正常人有异议会平和探讨,求同存异; 但病态者会一直无中生有, 死缠烂打。 尤其是网络上, 躲在ID后面, 更是如此。 对这种人讲道理都没用, 这就是为什么需要法律的干涉。

希望颜宁越战越勇。 这就是对耍赖的人最好的回应。
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