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第一例大概是在1月2号开始做的。在1月7日就获得了这个病毒的全基因组序列。

(2020-02-11 14:02:53) 下一个
作者:李晨 来源:科学网微信 发布时间:2020/2/3 18:39:31 选择字号:小 中 大 
武汉检验科博士:我们3通宵自测病毒序列,看到结果即感不妙 


晚上9点,是记者和刘为勇约定的采访时间。 

然而,直到深夜12点以后,他还没有回复微信。 

刘为勇在武汉,华中科技大学同济医学院附属同济医院检验科,做新型冠状病毒检测工作。 



刘为勇在实验室 

直到第二天下午,记者才等到他。 

熬3通宵测出全基因组序列 拿到结果有不好预感 

?《中国科学报》:您是哪一天接到第1个疑似样本的? 

● 刘为勇: 

我这边有记录。我们一直在监测,也向国家CDC反映过。我们第一例大概是在1月2号开始做的。在1月7日就获得了这个病毒的全基因组序列。 

?《中国科学报》:你们自己完成了测序? 

● 刘为勇: 

我们是一个团队,包括来自武汉大学病毒学国家重点实验室和中南医院的团队、中山大学团队和华中科技大学同济医学院附属同济医院的科研人员。大概4天就测出了病毒全基因组序列。 

相关成果已经写成文章,投给了国际期刊EMI(Emerging Microbes & Infections)。 

?《中国科学报》:论文内容您能介绍一下吗? 

● 刘为勇: 

论文讲的是我们针对两个病例,采了标本之后,第一时间做了检测。那时候是1月2日左右。当时高度怀疑是SARS,用某公司试剂盒测过后显示阳性。 

于是我们根据SARS病毒设计了6个引物,并利用病毒样本核酸模板做了PCR(聚合酶链式反应,是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术)。 

6对引物里面有一对可以工作。经过测序,我们发现这个病毒跟SARS差异很大,当时就怀疑是一个新的病毒了。 

同时开展的二代测序,拿到了病毒的全基因组序列。于是,我们发现这个病毒和已知6种冠状病毒都不一样,是新病毒,而且它跟SARS病毒进化关系比较近。 

?《中国科学报》:得到这个结论时是什么心情,有不好的预感吗? 

● 刘为勇: 

是有不好的预感,毕竟跟蝙蝠来源的SARS病毒亲缘关系较近。考虑到SARS曾经造成的严重后果,我们第一时间就把结果向中国CDC进行了书面汇报。 

?《中国科学报》:你们的团队是怎么合作的? 

● 刘为勇: 

我平时临床检测任务较多,做研究是在五点下班之后,我几乎每天都会去武汉大学那边,在我原来的合作导师那边做课题。 

疫情发生后,我们一起攻关,基本上熬了三个通宵,在第一时间把基因组序列搞出来,因为平时就是这种工作状态,也没有觉得特别辛苦。 

我们这几个人是普通工作者,但是我们做的事情,我觉得应该是在国内国际都属于一流的成绩。 

没有商业试剂盒,7天自己研发出试剂盒 

?《中国科学报》:你们现在用的哪个厂家的试剂盒? 

● 刘为勇: 

我现在用两家企业赠送的商用试剂盒同时做对比检测,由于法律法规要求,我自己提前研发的检测方法暂不能用于此次疫情的检测。不过这两个商用试剂盒的检出率有差别。 

?《中国科学报》:您自己研发了新病毒的测试方法? 

● 刘为勇: 

拿到全基因组序列以后,我就开始着手研发试剂盒。科室领导在研发方面给了我更多时间。 

这个检测方法用的是分子诊断技术。我们把荧光定量PCR和普通PCR加测序这两个方法结合起来,用于筛查病毒。这也是金标准之一。 

这里面用到的探针引物全部是我自己设计的。1月13日,我就把这个检测方法建立起来了。19日我提交了专利申请。 

?《中国科学报》:您开始做的时候,有没有信心一定能做出来? 

● 刘为勇: 

还是蛮有信心的,因为我已经累积了大概5年左右病毒病原体试剂盒研发经验。 

我们曾经研发了很多临床用的检测试剂盒,覆盖细菌、真菌、病毒和寄生虫,大概有30多种试剂盒。在投入临床使用前,我们也会认真进行各种性能评估。这些试剂盒在我们医院已提供临床诊断服务近万人次。 

不过根据政策规定,这些试剂盒不能用来盈利和推广,仅限医院内部使用。 

?《中国科学报》:您的测试方法好用吗? 

● 刘为勇: 

因为样本比较珍贵,数量并不多,所以我们大概用了十几份阳性样本,包括大便、血、尿样本来验证。

结果准确率达到100%。灵敏度很高,特异性非常高,不会被别的病毒干扰。 

大概从1月13日以后,我们开始用我的方法,对收到的样本进行新型冠状病毒的筛查。 

这是为了在疫情爆发的早期,医院心里有个底。 

这个工作是我们出于社会责任感自己做的,实际上患者没有要求,CDC也没有要求。但我们还是将早期筛查结果报告给了CDC。 

标本量特别大 连续工作21小时 

?《中国科学报》:您昨天工作了多长时间? 

● 刘为勇: 

接近21个小时。现在标本量特别大,没办法。昨天检测了大概100多例样本。 

?《中国科学报》:一下子激增的吗? 

● 刘为勇: 

由于疫控中心难以满足这么大量的检测需求,所以中国疾控中心(CDC)在1月26日就把检测权限下放到我们这种拥有P2等级生物安全实验室的大型医院。样本阳性的上报CDC,他们复核。那天起我们开始用商用试剂盒。阳性样本数量快速上升。 

这样做相当于为患者就诊开辟一个快速通道。 

?《中国科学报》:检验科的人手够吗? 

● 刘为勇: 

现在感觉是不够的。技师要有一定资质和从业经验,并不是每个人都能做的。 

我们还是以前那些人,大概十几个。除了检测以外,现在还要手动整理、上报大量患者信息,这个工作也非常花时间。 

一个医生一天看千个就诊者 这是“医疗挤兑” 

?《中国科学报》:外界觉得现在诊断的速度有点慢。您怎么看? 

● 刘为勇: 

现在有谣言说新型冠状病毒这个病很严重,得了就会死。这造成所有人不管大病小病,感冒、发烧都会往大医院挤。但不论哪个城市的医疗资源都是有限的。 

我们把这种情况叫做“医疗挤兑”。 

门诊的高峰期,一个医生一天要看1000多个就诊者,基本上就是不眨眼地看病,其实看一天也看不完。 

我听说门诊采血的护士一天至少工作12小时,累到趴在桌子上面就睡着了,那个桌子是很脏的,说明她确实累得受不了。 

而且患者大量聚集在医院还会造成更多的人际传播。 

地铁、公交也是疾病传播的重要场所。后来武汉市政府停止了公交和地铁系统运行,这是很明智的。 

现在已经把大量就诊者疏散出去了。因为武汉市实行了分级诊疗。这样是合理的。患者也不会那么恐慌。 

标本在我这里又不会打喷嚏 

?《中国科学报》:这一次疫情让您心慌了吗? 

● 刘为勇: 

这一次我感觉还好。因为我们作为医务工作者,自己都怕了,退缩了,怎么帮病人诊断、帮病人看病?

其次我们都有一定的科学素养,会理性对待和处理风险。 

这个病毒虽然传染性很强,但它主要是通过气溶胶传播,例如病人打喷嚏、采样环节暴露等容易被感染。 

但我的工作主要是针对标本,标本在我这里就很安静了,它又不会打喷嚏。 

真正危险的是在一线治疗和救护的护士、医生。请大家善待他们。 

?《中国科学报》:您现在的安全防护是什么样的?防护品够用吗?您觉得安心吗? 

● 刘为勇: 

我在P2实验室,我们每个人是按P3等级进行个人防护。P3等级个人防护服穿上就不能上厕所、吃饭、喝水,一天要换至少三套。 



检验科新型冠状病毒检测团队部分成员 

防护品检验科里暂时还够用。 

我对安全比较放心。不过毕竟按规定应该是P3实验室做检测,现在我们是在P2 实验室做。有感染风险是不可否认的。 

但是因为现在CDC检测容量有限,我们义不容辞。我们会继续做,绝不退缩。 

回到家孩子要抱抱,有时忍不住还是会抱一下 

?《中国科学报》:您这几天回过家吗? 

● 刘为勇: 

自己每天回家都非常晚,一个是怕传染给家人;二是本身工作也非常繁忙,临床工作之余,我还想去研究下这个病毒相关规律和临床现象。 

因为工作比较特殊,我们都会自我检查,目前为止检测人员没有因检测而感染。 

我有两个孩子,一个7岁,一个1岁半。有时候小孩子过来要我抱一下,还是忍不住抱抱,心里清楚还是应该隔离一下,但忍不住。 

?《中国科学报》:家人对你做这个工作担心吗? 

● 刘为勇: 

肯定担心,我母亲要求我有空就给她打电话报个平安。 

?《中国科学报》:你的同事们情况怎么样? 

● 刘为勇: 

都在加班加点,过年几乎都没怎么休息,很多同事都是每天工作到晚上12点,大家没有任何怨言,也为自己能参与到一线工作而感到骄傲和自豪。 

我也想请大家给予政府、疾病防控部门和医疗机构足够的信任和耐心,也请配合他们的统一部署和安排,众志成城,共克时艰。 

(文中图片均为刘为勇提供)
 
 
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大江川 回复 悄悄话 您的位置: 文学城 ? 新闻 ? 焦点新闻 ? 川普不戴口罩 携妻儿光顾中餐馆 力挺华人中餐业(视)
川普不戴口罩 携妻儿光顾中餐馆 力挺华人中餐业(视)
文章来源: 综合新闻 于 2020-02-18 09:58:52 - 新闻取自各大新闻媒体,新闻内容并不代表本网立场!
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由中国武汉爆发的2019新冠病毒疫情持续延烧,波及全球20多个国家与地区,至今为止美国被确诊病例为15例,从人口比例上来讲,比例并不算高,但还是对在美国的中餐业带来严重的打击,有的餐馆甚至为此倒闭。

美国总统川普为了力挺在美国的华人中餐业,最近携妻儿到华盛顿哥伦比亚特区的华人中餐馆就餐。

@realDonaldTrump and his wife @FLOTUS and his son Barron , to Washington DC Chinese restaurant, to support Chinese hit by #Coronavirius . 川普偕妻儿到华盛顿哥伦比亚特区中餐馆就餐,力挺因新冠肺炎疫情倍受打击的中餐业 pic.twitter.com/WPRSh5Ly2r

— Blanche LAU (@blanche124) February 18, 2020
大江川 回复 悄悄话 Zhong Nanshan: the first case of the new crown autopsy "lungs filled with mucus," and not the same as SARS
Source: ETTV on 2020-02-18 08:46:41 - news from the major news media, news content does not imply any position !!
(Readed)
Wuhan Jinyintan Hospital on the 16th led by Liu Liang, a professor of the Department of Forensic Medicine of Wuhan Tongji Medical College, successfully completed two pathological sections of the donated dead human body. For anatomy new crown pneumonia patients in general, the Chinese Academy of Engineering academician Zhong Nanshan said the new crown lungs of patients with pneumonia performance and SARS little bit different, "no severe fibrosis, a lot of mucus."


Mainland China on the 16th to complete the two cases of the new crown generally pneumonia Pathological anatomy. (Picture / Recapture our "Emergency Call")

According to Dongsen News today, patients with New Crown Pneumonia are "clogged with mucus"! Zhong Nanshan revealed autopsy details: different from SARS.

Since the outbreak of new crown pneumonia, relevant Chinese medical units have waited for government documents and family members to agree to donate the remains, and cannot perform pathological sectioning. According to "CCTV" news, China finally completed the autopsy of the first patient who died of new coronary pneumonia at 3 am on February 16, and successfully obtained the pathology of new coronary pneumonia. At 6:45 pm on the same day, the anatomy of the body of the second patient with new coronary pneumonia in China was successfully completed at Jinyintan Hospital. The two anatomy and pathology have been submitted for examination.

The report said that in response to the dissection of the remains of patients with neocoronary pneumonia, Zhong Nanshan responded on the 18th that the anatomy of the remains is very important. According to Zhong Nanshan, the lung performance of patients with new coronary pneumonia is a little different from SARS. "It is not as severe as we imagined. Fibrosis is not there yet. It seems that some alveoli are still there, but the inflammation is very severe. Very viscous mucus, which will lead to poor ventilation of the patient. "He said," further anatomy will show that we understand the characteristics of the disease, and we need to pay special attention to keeping the patient's airway open, and related research is still in progress. "

The report Said that Sun Yanrong, deputy director of the Biological Center of the Ministry of Science and Technology of China, said on the 17th that the antimalarial drug "chloroquine phosphate" has the efficacy against the new crown virus. In this regard, Zhong Nanshan believes that chloroquine phosphate is effective for coronavirus. If it is really used in humans, it is in this epidemic. "According to research from Guangdong and Beijing, a considerable number of patients can make the virus negative within 15 days. It is impossible now A rigorous clinical trial was performed, but compared with other drugs, the fever and virus disappeared about one day earlier. In addition, the side effects of chloroquine phosphate are not very large, such as patients with gastrointestinal symptoms such as diarrhea, tinnitus, etc. In general, Special effects are not enough, but will it help? From the existing signs, it should be helpful. "

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大江川 回复 悄悄话 钟南山:首例新冠尸检“肺塞满黏液”与非典不一样
文章来源: 东森新闻 于 2020-02-18 08:46:41 - 新闻取自各大新闻媒体,新闻内容并不代表本网立场!
(被阅读 次)
武汉金银潭医院16日在武汉同济医学院法医学系教授刘良带领下,顺利完成两例捐赠病逝人体的病理切片,报告最快10天出炉,可望找出病毒致死原因。针对解剖新冠肺炎患者大体的情况,中国工程院院士钟南山透露,新冠肺炎患者肺的表现和SARS有点不一样,“没有严重纤维化,还有大量的粘液。”


中国大陆16日完成2例新冠肺炎大体的病理解剖。(图/翻摄 我们《解急呼叫》)

据东森新闻今天报道说,新冠肺炎病患“肺部塞满黏液”!钟南山透露尸检细节:和SARS不同。

新冠肺炎爆发至今,中国相关医疗单位苦等政府公文和家属同意捐赠遗体,无法做病理切片。据《央视》消息,中国终于在2月16日凌晨3时许完成第一例新冠肺炎逝世患者的遗体解剖,并成功拿到新冠肺炎病理。同一日晚间6时45分,中国第二例新冠肺炎逝世患者的遗体解剖工作也在金银潭医院顺利完成,这两具解剖病理目前已被送检。

该报道说,针对解剖新冠肺炎患者遗体的情况,钟南山18日回应,遗体解剖很重要,“17年前SARS的时候,就通过遗体解剖说明了解肺本身病变情况以及肺以外全身脏器被破坏的情况。”据钟南山透露,新冠肺炎患者肺的表现和SARS有点不一样,“并不像我们想像的严重纤维化,现在还没有结果,看起来有一部分肺泡还存在,但是炎症很厉害,有大量非常黏的黏液,这将导致病人的通气不通顺。”他表示,“进一步解剖会说明我们认识这个病的特点,同时要特别注意让患者气道通畅,相关研究还正在进行中。”

该报道说,中国科技部生物中心副主任孙燕荣17日表示,抗疟疾药“磷酸氯喹”具有抗新冠病毒的药效。对此,钟南山认为,磷酸氯喹对冠状病毒有效,真正用在人体的话是在这次疫情中,“根据广东和北京的研究,相当一部分患者在15天之内能使病毒转阴性,现在不可能做严格的临床试验,但和其他药物对比,发热症状和病毒消失时间大概早一天,另外,磷酸氯喹的副作用不算很大,比如患者有消化道症状如腹泻、耳鸣等;总的来说,特效药够不上,但会不会有些帮助?从现有苗头来看,应该是有帮助。”

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大江川 回复 悄悄话 大概是几天前,来自香港的病毒学专家管轶来到武汉,只呆了一天,就对外宣称我要当逃兵,这次真的怕了,实际感染数是官方数字的十倍,三万起跳,当时言论一出,引起网络上一片骂战

我看了当时的评论:

1 管轶是个香港人,滚回你的香港去吧,别耸人听闻了

2 懦夫,什么狗屁病毒学家,浪得虚名吧

3 胆小鬼,透明人,没见过想当逃兵还自己说出来的

说实话,在没有了解事情真相和管轶水平情况下,很容易在媒体的煽动下作出非理性的判断,正是因为听多了可防可控,物资充足,无明显人传人的判断,一听到负面消息,特别是不客观的新闻报道,就一定会作出应激反应。

包括我在内,一直认为管轶是逃兵,是懦夫,耸人听闻,在大陆混不下去只能去香港吧。

然而稍微看了一下最新的采访和他的生平事迹,结合疫情数字,惊讶发现,管轶居然作出了最准确的判断。


我们先来了解一下管轶的简历:


管轶,1962年生于江西宁都,医学微生物学专家,英国皇家医学院外籍院士,香港大学于崇光基金教授席(病毒学)、新发病毒性疾病学讲座教授,香港大学新发传染性疾病国家重点实验室主任、香港大学流感研究中心主任。

管轶1983年毕业于江西医学院,获得学士学位,并留校担任江西医学院附属医院儿科讲师及住院医生;

1989年获得中国协和医科大学硕士学位,后入职于汕头大学医学院第一附属医院,任儿科主治医生;

1997年获得香港大学博士学位;2000年1月受聘返回香港大学医学院,历任研究助理教授、助理教授、副教授;2001年担任汕头大学医学院联合流感中心主任;2005年担任香港大学教授、新发传染性疾病国家重点实验室主任;2007年担任汕头大学微免教研室国际感染与免疫研究所主任;2013年获得何梁何利基金科学与技术进步奖

一、管轶是国际顶尖的病毒学家,国内屈指可数,他到底有多牛?

1,他的学术到底有多牛?

学术方面,已发表240多篇的SCI学术论文,包括:10篇science(科学)、9篇nature(自然)、3篇NEJM(新英格兰医学杂志)、10篇柳叶刀(世界权威医学杂志)、7篇nature子刊、14篇PNAS(美国科学院院报),h因子96。他的论文被引用次数达到近30000次,2014-2018年,连续五年被国家权威机构Thomson评为“高被引科学家”及全球最具影响力的科学家。2,Nature、Science有多牛?

这两个是全球上百万种学术期刊的金字塔顶,能在这两杂志上发一篇文章,在国内就可以直接教授博导,国内个别985高校,至今还没一篇。

算上世界上第三个最牛的期刊Cell(细胞),以上三个合成CNS论文,以第一身份发过两篇以上CNS论文的,百年来,中国大陆总共才二十六人,而中国科学院院士,只有一个人在这26人名单,其他院士绝大多数是一篇都没有。光凭论文的质量和数量,国内没有多少科学家,比管轶强。

3,世界上对他如何评价?管轶是最先提出果子狸是传播SARS冠状病毒的科学家之一,曾被美国《时代》杂志选为18位救人英雄之一、亚洲英雄。他是世界顶级的病毒专家,英国皇家医学院外籍院士。

在2003年SARS爆发期间,管轶带领团队,率先证明果子狸是SARS的直接来源,遏止了SARS的再次爆发及流行。他在果子狸身上找到SARS病毒,2003年底,有人感染变种SARS病毒,他和钟南山上报国务院,广东下令清除野生动物市场上所有果子狸,有效遏止了疫情的扩散。

通过长期的努力,管轶和他的团队已成功排出了250多个H5N1禽流感病毒的基因序列,基本摸清了中国禽流感起源、发生、变化的规律。他们的实验室已成为世界卫生组织 (WHO)在全球的八个参比实验室之一,已鉴定出世界上所有的20多种H5N1禽流感变异形。


近二十年,管轶和钟南山一直亲密合作,钟南山把管轶当做他最得意的学生,没有之一。

钟南山很赏识他的学生管轶,他曾经说:“管轶很聪明,在香港是很出名的一位微生物学家,也是禽流感方面的研究专家,一直在用心探索。” 早上8∶30分,钟南山拿起电话开始与管轶通话。管轶听见老师的声音,就急着问:“老师你现在怎么样?是不是很辛苦?要保重啊!”他听老师说到了香港,不禁喜出望外:“钟老师,你在哪里?我去接你!”当管轶听说老师6∶30分就到了,已经等了2个小时,而且就在他的楼下,他大吃一惊,心疼地说:“老师,您怎么能在车里等这么久?!”钟南山对管轶说:“我要见你。”

管轶说:“老师,我马上下楼去接您。”

钟南山说:“噢,不用了。我已经在你宿舍的楼下。”

二十年来,每当我国面临流感性的问题,都是钟南山和管轶联合做,两个人是师生关系,也是同事关系,呕心沥血,解决了我国的一个又一个的流感问题,为了中国的民众健康,做出了巨大的贡献。

我的评价:

从管轶的过往经历来看,也是穷孩子出生,83年上大学,那时候大学生相当金贵,说明很聪明很刻苦,协和医院院毕业当过儿科主治医生,后来香港大学发展,可以说既有实际经验又有理论高度,而且还是钟南山最得意弟子,非典时期作出了巨大贡献,所以获得了最高荣誉,巧合的是和饶毅是同班同学,应该来说,正是管轶香港人的身份,使得他变成了中国最敢说真话的人,而且应该是身经百战之后的经验之谈。




我们来看看他来武汉经历了什么:

这里似乎不欢迎防疫专家,管轶首先谈到的是感受:“我就马上撤离武汉了,这里似乎不欢迎防疫专家,不需要科学家。” 他的武汉之行(1月21日上午到,22日下午2点飞走),目的是做研究,是去寻找新型肺炎源头,以便能够像当年在广东调查SARS病原一样,找到元凶从而遏制肆虐。不料,到达那里后,却发现当地人完全没有风险意识。最可怕的是,病毒的源头都已经被销毁得干干净净!

除了相关机构,百姓们也似乎刚刚睡醒。他说:“就像一个可能受到原子弹攻击的地方,人们却还在打开派对,没有任何战争动员和准备。”他简直想呐喊了:“这里已经成为疫区!我更担心的是好像原子弹爆炸冲击波会使国民损失多么大。”

不论怎样,武汉之行使得这位病毒专家已经发现,这种新肺炎的特征跟SARS非常相似,而且甚至有过之而无不及,特别是没有感冒发烧症状的人也会传播!他说,第一波的传播早已经开始,而从15号开始武汉已经出现返乡人潮。返乡人潮中可能也都会有带病毒者。




文章写到这里,再往深处挖掘,可能就要被封了,最后我就留给读者自己去思考吧

1 能不能给有真才实学的专家和技术人员,在合适的场合渠道公布他们的发现的机会,而不要因为他们的判断是负面的而一棒子打死。

2 在爆出来负面消息的时候,能不能安排一定的专家进行甄别,而不要一味封杀负面消息,解决提出问题的人

3 对于合法渠道曝光负面消息的勇士,能不能给与一定的奖赏

4 我们普通人在听到不想听到的负面消息的时候,能不能客观冷静分析一下?

我们需要改进的地方太多了,同时也说明进步空间很大!
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